More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1069 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1069  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0686791  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2718  ABC transporter related  53.39 
 
 
263 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  50.79 
 
 
270 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0118  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.03 
 
 
378 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.435278  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3243  ABC transporter related  53.57 
 
 
267 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.876591 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2339  ABC transporter, ATPase subunit  51.37 
 
 
263 aa  251  9.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  46.89 
 
 
378 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2105  ABC transporter related  51.57 
 
 
263 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  46.89 
 
 
378 aa  249  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3336  ABC transporter related  50.57 
 
 
264 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314642  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.19 
 
 
376 aa  244  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 
375 aa  241  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2252  ABC transporter related  49.8 
 
 
257 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.91 
 
 
375 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.41 
 
 
370 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  48.52 
 
 
376 aa  238  5.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6069  putative glycine betaine/carnitine/choline ABC transporter ATP-binding protein  52.17 
 
 
291 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  46 
 
 
314 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 
315 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  47.9 
 
 
317 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  46.84 
 
 
324 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 
382 aa  236  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 
315 aa  234  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  45.2 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1276  ABC transporter related  46.72 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 
315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 
315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 
315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 
315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  52.07 
 
 
318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  49.78 
 
 
392 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2099  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.57 
 
 
321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 
315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3109  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.97 
 
 
389 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  49.59 
 
 
353 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4310  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 
385 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944105  normal  0.26992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  48.43 
 
 
382 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  48.43 
 
 
382 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  48.43 
 
 
382 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  48.43 
 
 
382 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  48.43 
 
 
382 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.26 
 
 
379 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  50.43 
 
 
326 aa  232  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  48.79 
 
 
312 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 
315 aa  232  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  49.19 
 
 
312 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0868  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 
385 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0898  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 
385 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706016  normal  0.516388 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 
315 aa  231  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  45.76 
 
 
328 aa  229  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.03 
 
 
377 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0912  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 
385 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4962  ABC transporter related  45.23 
 
 
328 aa  229  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  45.9 
 
 
312 aa  228  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0546  ABC transporter related  49.79 
 
 
368 aa  228  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136652  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001530  L-proline Glycine Betaine ABC transport ATP-binding protein proV  45.11 
 
 
389 aa  228  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  47.76 
 
 
312 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13580  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 
387 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1375  ABC transporter related  50.63 
 
 
254 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0452  ABC transporter related  49.79 
 
 
344 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1635  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.37 
 
 
397 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  43.95 
 
 
312 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1516  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.62 
 
 
383 aa  226  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000189074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1126  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.37 
 
 
367 aa  225  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 
398 aa  225  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1215  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 
387 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  50 
 
 
244 aa  224  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 
351 aa  225  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1620  ABC transporter related  50.21 
 
 
317 aa  224  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
381 aa  224  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
312 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
312 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0803  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  44.58 
 
 
386 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0426806  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.07 
 
 
408 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.07 
 
 
408 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1974  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
312 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1140  ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
312 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0408912  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2493  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  48.18 
 
 
388 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957361  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2132  ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
312 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314823  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7553  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 
391 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1993  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
312 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0239  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
312 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.46205  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5139  ABC transporter related  47.98 
 
 
317 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192374  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1580  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
312 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0920  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
312 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  47.98 
 
 
312 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0497  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  47.58 
 
 
312 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975936  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3224  ABC transporter related  47.98 
 
 
317 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  45.61 
 
 
334 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5143  ABC transporter related  47.98 
 
 
317 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310364  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
418 aa  222  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
395 aa  222  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2380  ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 
312 aa  222  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.850605  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  44.73 
 
 
400 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2354  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  45.02 
 
 
393 aa  222  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  45.61 
 
 
321 aa  222  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.94 
 
 
370 aa  222  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4575  glycine betaine/choline OpuC ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 
385 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3624  ABC transporter related  45.57 
 
 
314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0802  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  45.57 
 
 
398 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.478782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>