More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0833 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  100 
 
 
192 aa  386  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  38.97 
 
 
203 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  37.43 
 
 
189 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  36.9 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  37.5 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  41.67 
 
 
180 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  35.14 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.14 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  34.02 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.57 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  41.36 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  34.72 
 
 
188 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  33.33 
 
 
186 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.16 
 
 
186 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  34.57 
 
 
186 aa  104  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  33.33 
 
 
186 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  33.33 
 
 
186 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  33.33 
 
 
186 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  35.79 
 
 
188 aa  101  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  37.17 
 
 
185 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  35.64 
 
 
178 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  31.66 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  37.82 
 
 
441 aa  99.8  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  32.43 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  38.71 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  34.57 
 
 
182 aa  99.4  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  32.81 
 
 
222 aa  99  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  36 
 
 
189 aa  97.8  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  30.81 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  31.58 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  32.09 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  33.15 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  30.81 
 
 
193 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  37.63 
 
 
176 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  35.83 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  31.58 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  34.92 
 
 
203 aa  94.7  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  36.46 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  34.21 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  35.14 
 
 
206 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  39.74 
 
 
416 aa  91.7  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  35.23 
 
 
191 aa  91.3  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  35.11 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.7 
 
 
186 aa  89  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  36.56 
 
 
177 aa  88.6  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  35.6 
 
 
175 aa  88.2  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  29.95 
 
 
190 aa  88.6  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  34.04 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  32.98 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  34.41 
 
 
197 aa  87  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  33.33 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  31.58 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  35.79 
 
 
420 aa  84.3  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  30 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  30 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  30.41 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  32.26 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  30 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  33.33 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  32.8 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  27.68 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  27.96 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  31.07 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  29.95 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  29.32 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  30.89 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  29.32 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  34.22 
 
 
406 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  33.69 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  35.42 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  31.72 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  37.23 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  31.05 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  31.38 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  33.33 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  29 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  27.51 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  31.91 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  28.27 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  34.41 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  33.51 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  37.43 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  31.55 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  36.84 
 
 
421 aa  75.1  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  31.38 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  31.11 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  31.11 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  32.09 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  31.55 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  31.55 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  29.41 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  33.33 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  32.98 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  28.42 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  31.55 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  31.55 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  29.1 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3871  putative cytochrome b561  31.16 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  30 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  31.89 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>