More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0435 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0435  DNA polymerase III subunits gamma and tau  100 
 
 
606 aa  1204    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.853663  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4077  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.9 
 
 
626 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0256  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.24 
 
 
651 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0966021  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4057  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.23 
 
 
600 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.495634  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2365  DNA polymerase III subunits gamma and tau  53.37 
 
 
580 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2196  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.67 
 
 
626 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3649  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.87 
 
 
592 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.89772  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1861  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47 
 
 
628 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.33363  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0710  DNA polymerase III subunits gamma and tau  53.19 
 
 
582 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.27 
 
 
602 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0330154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7346  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.61 
 
 
613 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4397  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.63 
 
 
625 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.27 
 
 
602 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.330023  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.43 
 
 
605 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00653224  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0650  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.65 
 
 
587 aa  472  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0107119  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1812  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.45 
 
 
623 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181409  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3432  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.55 
 
 
625 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0369  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.4 
 
 
611 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.797615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0110  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.51 
 
 
631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801093  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.95 
 
 
582 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4575  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.18 
 
 
632 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0462  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.04 
 
 
615 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1238  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.23 
 
 
634 aa  460  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0619  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.88 
 
 
623 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0274  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.9 
 
 
628 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0668  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.02 
 
 
627 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.18 
 
 
624 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.818033  normal  0.0455941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.16 
 
 
659 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0166  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.64 
 
 
608 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0255  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.78 
 
 
623 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.36 
 
 
605 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3876  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.2 
 
 
584 aa  440  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3142  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  56.46 
 
 
637 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2168  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  58.66 
 
 
622 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531905  normal  0.517298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4752  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  58.16 
 
 
605 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169989  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4848  DNA polymerase III subunits gamma and tau  55.67 
 
 
618 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4336  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2000  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.74 
 
 
614 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.49 
 
 
565 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  57.4 
 
 
687 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0213338 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1357  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.5 
 
 
573 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0803491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  53.79 
 
 
582 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  44.24 
 
 
605 aa  319  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_002978  WD1060  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  33.75 
 
 
533 aa  317  6e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077321  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2534  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.28 
 
 
752 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.821414  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.42 
 
 
637 aa  301  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000410993  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.6 
 
 
505 aa  296  8e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.547641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.22 
 
 
1040 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  43.92 
 
 
955 aa  293  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1599  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.13 
 
 
692 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0852408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4269  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.13 
 
 
691 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  44.48 
 
 
1002 aa  290  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39 
 
 
948 aa  290  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.77 
 
 
921 aa  290  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.48 
 
 
1071 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.48 
 
 
1045 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3646  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.53 
 
 
743 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1825  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.53 
 
 
736 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  39.69 
 
 
696 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2302  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.18 
 
 
957 aa  288  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000141755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  38.11 
 
 
582 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.52 
 
 
939 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.86 
 
 
911 aa  287  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.26 
 
 
643 aa  287  5e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.32 
 
 
587 aa  286  8e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.77 
 
 
642 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1805  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.8 
 
 
696 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.32 
 
 
1137 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000443473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.75 
 
 
681 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.77 
 
 
642 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0942  DNA-directed DNA polymerase  39.08 
 
 
491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.72 
 
 
1147 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000534901  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.72 
 
 
384 aa  284  3.0000000000000004e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.46 
 
 
579 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  38.23 
 
 
529 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.82 
 
 
642 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19830  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.19 
 
 
694 aa  283  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 
580 aa  283  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.54 
 
 
582 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0588  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.55 
 
 
642 aa  283  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2647  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.12 
 
 
692 aa  282  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.377545  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.92 
 
 
1115 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.65 
 
 
701 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00421  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.12 
 
 
643 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00199359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.12 
 
 
643 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0544  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.22 
 
 
642 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2690  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.78 
 
 
1137 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00745534  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.12 
 
 
643 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  44.12 
 
 
643 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.21 
 
 
1113 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.12 
 
 
643 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.12 
 
 
643 aa  281  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.12 
 
 
643 aa  281  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.12 
 
 
643 aa  281  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.66 
 
 
599 aa  281  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.8 
 
 
690 aa  280  7e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.09 
 
 
687 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.09 
 
 
689 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.87 
 
 
774 aa  279  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.23 
 
 
579 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.19 
 
 
914 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>