More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0407 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  43.87 
 
 		 868 aa  662    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  44.91 
 
 		 859 aa  733    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  44.8 
 
 		 859 aa  733    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  51.4 
 
 		 878 aa  834    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  43.45 
 
 		 850 aa  647    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  43.81 
 
 		 868 aa  656    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  100 
 
 		 857 aa  1733    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  43.1 
 
 		 864 aa  629  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  32.12 
 
 		 471 aa  212  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  31.67 
 
 		 471 aa  209  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  32.13 
 
 		 455 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  32.02 
 
 		 469 aa  206  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  32.39 
 
 		 471 aa  206  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  33.15 
 
 		 410 aa  203  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  30.74 
 
 		 450 aa  202  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  32.28 
 
 		 471 aa  201  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  34.34 
 
 		 409 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  32.98 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  31.29 
 
 		 458 aa  199  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  30.13 
 
 		 450 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  32.05 
 
 		 458 aa  197  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  31.83 
 
 		 455 aa  197  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  30.15 
 
 		 451 aa  194  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  32.47 
 
 		 449 aa  194  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  31.82 
 
 		 449 aa  194  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  29.46 
 
 		 437 aa  194  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  31.82 
 
 		 449 aa  194  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  31.82 
 
 		 449 aa  194  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  32.47 
 
 		 449 aa  194  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  31.82 
 
 		 449 aa  194  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  32.47 
 
 		 449 aa  194  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  29.13 
 
 		 456 aa  193  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  31.82 
 
 		 449 aa  193  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  29.74 
 
 		 440 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  32.26 
 
 		 449 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  30.86 
 
 		 471 aa  191  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  30.02 
 
 		 454 aa  191  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  33.05 
 
 		 451 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  31.97 
 
 		 406 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  32.2 
 
 		 451 aa  188  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  33.61 
 
 		 421 aa  188  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  32.84 
 
 		 451 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  32.84 
 
 		 451 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  33.47 
 
 		 451 aa  187  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  31.73 
 
 		 471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  33.05 
 
 		 451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  33.79 
 
 		 434 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  31.56 
 
 		 461 aa  186  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  32.84 
 
 		 451 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  30.81 
 
 		 416 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  32.84 
 
 		 451 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  32.84 
 
 		 451 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  30.43 
 
 		 449 aa  185  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  31.34 
 
 		 461 aa  184  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  31.34 
 
 		 461 aa  184  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  32.53 
 
 		 398 aa  183  9.000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  32.08 
 
 		 406 aa  183  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  30.37 
 
 		 449 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  30.37 
 
 		 449 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  30.37 
 
 		 449 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  30.37 
 
 		 449 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  30.37 
 
 		 449 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3425  aspartate kinase III  32.39 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000055532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  33.98 
 
 		 452 aa  180  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_002950  PG2189  aspartate kinase  30.57 
 
 		 446 aa  179  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  32.88 
 
 		 425 aa  179  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  30.15 
 
 		 814 aa  179  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  31.17 
 
 		 424 aa  178  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  31.84 
 
 		 450 aa  177  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  33.04 
 
 		 459 aa  177  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  32.27 
 
 		 452 aa  177  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  30.66 
 
 		 823 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  30.75 
 
 		 402 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  32.25 
 
 		 421 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  30.8 
 
 		 449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  29.81 
 
 		 441 aa  174  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  32.91 
 
 		 456 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  31.16 
 
 		 456 aa  172  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29 
 
 		 820 aa  172  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  27.71 
 
 		 444 aa  171  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  27.99 
 
 		 468 aa  170  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0411  aspartate kinase  28.91 
 
 		 804 aa  170  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.204569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  30.39 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.42 
 
 		 819 aa  168  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  31.91 
 
 		 450 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.72 
 
 		 823 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5565  aspartate kinase  32.71 
 
 		 414 aa  167  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  30.02 
 
 		 449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3024  diaminopimelate decarboxylase  31.47 
 
 		 420 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25490  aspartate kinase  35.38 
 
 		 450 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3284  diaminopimelate decarboxylase  32.53 
 
 		 420 aa  166  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.71 
 
 		 817 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  31.47 
 
 		 420 aa  165  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0852  diaminopimelate decarboxylase  31.47 
 
 		 420 aa  165  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  31.47 
 
 		 420 aa  165  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  31.47 
 
 		 420 aa  165  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  31.47 
 
 		 420 aa  165  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2986  diaminopimelate decarboxylase  31.2 
 
 		 420 aa  165  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0454398 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  30.34 
 
 		 819 aa  166  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  31.2 
 
 		 420 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>