More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3721 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  100 
 
 		 444 aa  917    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  60.76 
 
 		 452 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  58.09 
 
 		 441 aa  515  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  57.67 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  57.08 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_002950  PG2189  aspartate kinase  49.89 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  35.19 
 
 		 450 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  35.12 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  35.19 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  34.62 
 
 		 471 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  33.19 
 
 		 471 aa  256  7e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  33.48 
 
 		 471 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  33.26 
 
 		 471 aa  253  6e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  32.97 
 
 		 471 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  33.12 
 
 		 471 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  35.18 
 
 		 450 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  34.15 
 
 		 454 aa  242  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  33.41 
 
 		 455 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  34.15 
 
 		 451 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  35.22 
 
 		 456 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  34.38 
 
 		 451 aa  236  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  34.15 
 
 		 451 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  34.15 
 
 		 451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  32.07 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  34.15 
 
 		 451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  35.49 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  33.26 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  33.26 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  33.26 
 
 		 451 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  33.26 
 
 		 451 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  32.6 
 
 		 458 aa  229  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  32.38 
 
 		 458 aa  229  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  33.93 
 
 		 456 aa  229  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  34.82 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  33.33 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  33.48 
 
 		 449 aa  226  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  32.44 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  33.04 
 
 		 452 aa  225  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  32.14 
 
 		 469 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  32.44 
 
 		 461 aa  222  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  32.22 
 
 		 461 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  32.22 
 
 		 461 aa  221  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  31.96 
 
 		 471 aa  221  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  31.02 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  32.05 
 
 		 818 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3425  aspartate kinase III  33.55 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000055532  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  31.99 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  33.05 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  30.58 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  33.48 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.74 
 
 		 815 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  32.89 
 
 		 449 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  32.89 
 
 		 449 aa  210  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  32.89 
 
 		 449 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  32.89 
 
 		 449 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  32.89 
 
 		 449 aa  209  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.48 
 
 		 818 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  33.76 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  32.89 
 
 		 449 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  32.89 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  32.89 
 
 		 449 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  32.67 
 
 		 449 aa  206  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25490  aspartate kinase  34.14 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  32.81 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  32.59 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  32.59 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.04 
 
 		 819 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  32.59 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  32.59 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.18 
 
 		 817 aa  199  7.999999999999999e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  29.03 
 
 		 823 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  29.93 
 
 		 815 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  31.13 
 
 		 814 aa  192  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  31.6 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  29.4 
 
 		 878 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  32.05 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  31.78 
 
 		 468 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  31.78 
 
 		 468 aa  189  7e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.69 
 
 		 819 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.22 
 
 		 815 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.81 
 
 		 823 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  27.86 
 
 		 819 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.51 
 
 		 815 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  29.73 
 
 		 465 aa  172  9e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  29.02 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.9 
 
 		 835 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  27.71 
 
 		 857 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  28.14 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.43 
 
 		 819 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03328  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.37 
 
 		 804 aa  170  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.93 
 
 		 819 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.21 
 
 		 820 aa  169  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.74 
 
 		 819 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.14 
 
 		 820 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  29.01 
 
 		 472 aa  167  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.99 
 
 		 820 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  28.42 
 
 		 478 aa  166  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.23 
 
 		 819 aa  166  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.23 
 
 		 819 aa  166  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.23 
 
 		 819 aa  166  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>