More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3840 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  84.22 
 
 
450 aa  743    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  94.9 
 
 
451 aa  847    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  78.4 
 
 
456 aa  684    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  76.39 
 
 
449 aa  669    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  95.12 
 
 
451 aa  850    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  94.68 
 
 
451 aa  846    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  87.02 
 
 
459 aa  741    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  95.12 
 
 
451 aa  850    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  85.33 
 
 
452 aa  766    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  99.56 
 
 
451 aa  912    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  100 
 
 
451 aa  917    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  99.56 
 
 
451 aa  914    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  81.82 
 
 
452 aa  716    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  83.07 
 
 
450 aa  749    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  93.79 
 
 
451 aa  835    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  99.56 
 
 
451 aa  912    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  60.36 
 
 
455 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  58.71 
 
 
458 aa  531  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  58.93 
 
 
454 aa  532  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  59.82 
 
 
455 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  58.3 
 
 
458 aa  524  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  57.08 
 
 
450 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  57.75 
 
 
451 aa  512  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  56.4 
 
 
450 aa  504  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  58.48 
 
 
449 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  60.4 
 
 
449 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  60.4 
 
 
449 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  60.4 
 
 
449 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  57.62 
 
 
461 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  57.62 
 
 
461 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  60.4 
 
 
449 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  60.63 
 
 
449 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  60.63 
 
 
449 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  60.4 
 
 
449 aa  491  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  57.4 
 
 
461 aa  491  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  60.4 
 
 
449 aa  491  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  60.18 
 
 
449 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  59.96 
 
 
449 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  59.96 
 
 
449 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  59.96 
 
 
449 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  59.96 
 
 
449 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  59.96 
 
 
449 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  52.11 
 
 
456 aa  448  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  51.79 
 
 
449 aa  443  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3425  aspartate kinase III  51 
 
 
452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000055532  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  37.45 
 
 
471 aa  286  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  37.58 
 
 
471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  38.97 
 
 
469 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  36.99 
 
 
471 aa  282  8.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  35.55 
 
 
471 aa  282  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  37.55 
 
 
471 aa  280  5e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  38.46 
 
 
471 aa  276  5e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  36.44 
 
 
471 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  33.92 
 
 
440 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.19 
 
 
815 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  37.34 
 
 
456 aa  247  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  35.28 
 
 
541 aa  246  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  34.07 
 
 
452 aa  246  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  33.26 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.35 
 
 
817 aa  240  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  33.85 
 
 
441 aa  239  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  33.41 
 
 
437 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  34.93 
 
 
823 aa  230  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  34.86 
 
 
814 aa  227  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25490  aspartate kinase  40.04 
 
 
450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  33.12 
 
 
468 aa  224  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  32.98 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  35.05 
 
 
467 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.97 
 
 
815 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  34.26 
 
 
878 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  32.76 
 
 
859 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  30.37 
 
 
818 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  32.91 
 
 
472 aa  213  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  32.33 
 
 
859 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.41 
 
 
822 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  35.89 
 
 
467 aa  206  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.2 
 
 
822 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.2 
 
 
822 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  33.48 
 
 
462 aa  205  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.98 
 
 
822 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.34 
 
 
822 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.98 
 
 
822 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  33.12 
 
 
478 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.77 
 
 
822 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.77 
 
 
822 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.49 
 
 
822 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  32.62 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  32.18 
 
 
446 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.89 
 
 
821 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.83 
 
 
834 aa  199  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  33.05 
 
 
857 aa  199  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  31.77 
 
 
467 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.35 
 
 
818 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  32.83 
 
 
463 aa  196  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  32.75 
 
 
868 aa  196  7e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  31.45 
 
 
465 aa  196  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1980  aspartate kinase  31.4 
 
 
469 aa  195  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0255525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  30.3 
 
 
815 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  31.9 
 
 
819 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  32.48 
 
 
468 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>