More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4477 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  100 
 
 
449 aa  906    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.476812 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  93.32 
 
 
449 aa  781    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  93.32 
 
 
449 aa  781    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  81.21 
 
 
455 aa  750    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  99.78 
 
 
449 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  93.1 
 
 
449 aa  776    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  80.9 
 
 
458 aa  743    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  82.02 
 
 
461 aa  726    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  81.8 
 
 
461 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  80.67 
 
 
455 aa  718    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  86.41 
 
 
449 aa  771    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  93.32 
 
 
449 aa  778    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  93.32 
 
 
449 aa  781    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  93.54 
 
 
449 aa  781    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  99.78 
 
 
449 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  93.32 
 
 
449 aa  778    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  93.32 
 
 
449 aa  780    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  93.54 
 
 
449 aa  780    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  100 
 
 
449 aa  906    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  81.61 
 
 
454 aa  751    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  81.8 
 
 
461 aa  724    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  100 
 
 
449 aa  906    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  81.12 
 
 
458 aa  743    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  60.63 
 
 
451 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  60.63 
 
 
451 aa  521  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  60.63 
 
 
451 aa  519  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  60.4 
 
 
451 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  60.18 
 
 
451 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  60.18 
 
 
451 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  59.96 
 
 
451 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  59.96 
 
 
451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  57.33 
 
 
450 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  59.96 
 
 
451 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  59.73 
 
 
452 aa  513  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  57.11 
 
 
450 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  59.96 
 
 
452 aa  501  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  58.17 
 
 
450 aa  498  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  58.43 
 
 
456 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  55.33 
 
 
451 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  58.93 
 
 
459 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  57.94 
 
 
450 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  57.49 
 
 
449 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  51 
 
 
456 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  48.09 
 
 
449 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3425  aspartate kinase III  46.77 
 
 
452 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000055532  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  38.56 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  39.62 
 
 
471 aa  300  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  39.35 
 
 
471 aa  295  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  39.14 
 
 
471 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  39.74 
 
 
471 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  39.02 
 
 
471 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  37.68 
 
 
471 aa  288  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  37.12 
 
 
469 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  33.85 
 
 
440 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  36.15 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  33.41 
 
 
441 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  34.07 
 
 
541 aa  238  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  34.98 
 
 
878 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  32.96 
 
 
437 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  32.89 
 
 
444 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  32.52 
 
 
452 aa  227  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  32.91 
 
 
818 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.3 
 
 
859 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.09 
 
 
859 aa  220  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25490  aspartate kinase  39.01 
 
 
450 aa  218  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.74 
 
 
815 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.77 
 
 
817 aa  216  8e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  32.47 
 
 
823 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  34.21 
 
 
446 aa  210  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.04 
 
 
815 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  32.83 
 
 
814 aa  207  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2189  aspartate kinase  31.29 
 
 
446 aa  206  7e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.47 
 
 
864 aa  203  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.75 
 
 
857 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  32.25 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.53 
 
 
868 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  33.62 
 
 
463 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.33 
 
 
820 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.4 
 
 
850 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  31.97 
 
 
467 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  30.74 
 
 
868 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  31.26 
 
 
472 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.96 
 
 
822 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.41 
 
 
818 aa  189  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  31.82 
 
 
462 aa  189  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.02 
 
 
822 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.32 
 
 
822 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.55 
 
 
820 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.55 
 
 
820 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.55 
 
 
820 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.55 
 
 
820 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.54 
 
 
822 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.96 
 
 
822 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0905  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.29 
 
 
821 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.32 
 
 
822 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.32 
 
 
822 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.55 
 
 
820 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  34.25 
 
 
467 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.75 
 
 
822 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  29.44 
 
 
465 aa  186  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>