More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0462 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  82.55 
 
 
449 aa  700    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  82.55 
 
 
449 aa  699    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  82.55 
 
 
449 aa  699    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  81.21 
 
 
449 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  89.09 
 
 
458 aa  813    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  81.21 
 
 
449 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  81.84 
 
 
461 aa  732    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  82.55 
 
 
449 aa  697    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  82.33 
 
 
449 aa  696    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  100 
 
 
455 aa  919    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  80.79 
 
 
455 aa  739    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  82.55 
 
 
449 aa  699    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  82.55 
 
 
449 aa  699    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  81.21 
 
 
449 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  82.55 
 
 
449 aa  699    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  82.55 
 
 
449 aa  697    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  81.61 
 
 
461 aa  730    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  81.21 
 
 
449 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  79.46 
 
 
449 aa  722    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  91.43 
 
 
454 aa  839    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  81.61 
 
 
461 aa  730    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  81.21 
 
 
449 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  88.2 
 
 
458 aa  808    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  60.58 
 
 
451 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  60.36 
 
 
451 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  60.13 
 
 
452 aa  523  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  60.36 
 
 
451 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  59.91 
 
 
451 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  60.36 
 
 
451 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  60.58 
 
 
451 aa  521  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  60.36 
 
 
451 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  60.36 
 
 
451 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  60.36 
 
 
451 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  57.91 
 
 
450 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  56.05 
 
 
450 aa  500  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  55.11 
 
 
451 aa  498  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  60.04 
 
 
459 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  55.61 
 
 
450 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  58.8 
 
 
452 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  57.24 
 
 
456 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  58.35 
 
 
450 aa  488  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  56.57 
 
 
449 aa  487  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  50.11 
 
 
456 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  45.56 
 
 
449 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3425  aspartate kinase III  45.35 
 
 
452 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000055532  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  38.09 
 
 
471 aa  316  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  38.77 
 
 
471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  38.35 
 
 
471 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  37.98 
 
 
471 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  38.85 
 
 
471 aa  300  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  37.37 
 
 
471 aa  293  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  36.31 
 
 
471 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  36.46 
 
 
469 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  35.76 
 
 
437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  34.51 
 
 
441 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  34.27 
 
 
456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  32.89 
 
 
440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  33.48 
 
 
541 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  33.41 
 
 
444 aa  239  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  33.7 
 
 
452 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  32.01 
 
 
818 aa  223  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  33.91 
 
 
878 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2189  aspartate kinase  31.49 
 
 
446 aa  219  8.999999999999998e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.52 
 
 
859 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.3 
 
 
859 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.2 
 
 
815 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  32.47 
 
 
823 aa  210  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25490  aspartate kinase  36.26 
 
 
450 aa  209  6e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  32.68 
 
 
478 aa  209  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  32.97 
 
 
446 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  32.4 
 
 
467 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  30.87 
 
 
864 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.47 
 
 
868 aa  204  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.32 
 
 
817 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  31.68 
 
 
814 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  30.24 
 
 
868 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.69 
 
 
850 aa  199  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  33.05 
 
 
462 aa  199  9e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.36 
 
 
818 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.83 
 
 
857 aa  197  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  31.98 
 
 
472 aa  196  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  33.26 
 
 
467 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  32.62 
 
 
463 aa  195  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  31.56 
 
 
465 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29 
 
 
815 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  30.3 
 
 
468 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  29.53 
 
 
465 aa  194  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  28.81 
 
 
468 aa  188  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.59 
 
 
820 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  30.5 
 
 
462 aa  187  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0535  aspartate kinase  29.5 
 
 
419 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  29.54 
 
 
815 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  29.46 
 
 
819 aa  183  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.52 
 
 
823 aa  182  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1980  aspartate kinase  29.92 
 
 
469 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0255525  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02310  lysine-sensitive aspartokinase III (aspartate kinase III)  29.21 
 
 
417 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.76 
 
 
822 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.33 
 
 
822 aa  179  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  28.6 
 
 
463 aa  179  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.34 
 
 
819 aa  179  9e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>