More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0535 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0535  aspartate kinase  100 
 
 
419 aa  860    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02310  lysine-sensitive aspartokinase III (aspartate kinase III)  64.03 
 
 
417 aa  562  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0283  aspartate kinase  62.98 
 
 
416 aa  535  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00335485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5565  aspartate kinase  49.76 
 
 
414 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2925  aspartate kinase  47.38 
 
 
424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102546  hitchhiker  0.00016365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3064  aspartate kinase  42.28 
 
 
421 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0369  hypothetical protein  33.17 
 
 
427 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  33.92 
 
 
818 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  30.71 
 
 
823 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  29.65 
 
 
454 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  29.5 
 
 
455 aa  186  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  30.08 
 
 
458 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  29.82 
 
 
458 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  31.14 
 
 
450 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  31.14 
 
 
455 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.82 
 
 
818 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  31.16 
 
 
819 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  29.95 
 
 
456 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  32.11 
 
 
449 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.23 
 
 
815 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  32.31 
 
 
450 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  29.71 
 
 
471 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  28.05 
 
 
471 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.05 
 
 
817 aa  176  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  31.2 
 
 
451 aa  176  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.68 
 
 
823 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  33.25 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  31.44 
 
 
541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.19 
 
 
819 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.9 
 
 
819 aa  173  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  31.56 
 
 
461 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  34.27 
 
 
449 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  34.27 
 
 
449 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  34.27 
 
 
449 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  31.28 
 
 
461 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  31.2 
 
 
461 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  34.27 
 
 
449 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  34.27 
 
 
449 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  34.27 
 
 
449 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  34.27 
 
 
449 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  34.27 
 
 
449 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  32.63 
 
 
450 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  29.66 
 
 
471 aa  170  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  32.54 
 
 
462 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 
814 aa  168  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.21 
 
 
819 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.33 
 
 
819 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  33.99 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  30.23 
 
 
471 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.1 
 
 
822 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  33.45 
 
 
462 aa  166  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  33.44 
 
 
467 aa  166  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.25 
 
 
835 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.33 
 
 
834 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  31.27 
 
 
449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  30.79 
 
 
450 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.89 
 
 
822 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.5 
 
 
835 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  31.97 
 
 
471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  28.67 
 
 
471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.1 
 
 
822 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  30.34 
 
 
451 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  30.34 
 
 
451 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  32.39 
 
 
449 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  30.34 
 
 
451 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  32.39 
 
 
449 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  30.34 
 
 
451 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  32.39 
 
 
449 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  32.39 
 
 
449 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.77 
 
 
822 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  31.33 
 
 
451 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  32.39 
 
 
449 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  30.63 
 
 
452 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.77 
 
 
822 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.77 
 
 
819 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.22 
 
 
822 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  34.19 
 
 
467 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  31.25 
 
 
451 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  31.25 
 
 
451 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.49 
 
 
820 aa  160  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  31.11 
 
 
456 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.57 
 
 
822 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.57 
 
 
822 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.55 
 
 
819 aa  159  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  30.45 
 
 
451 aa  159  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  34.85 
 
 
467 aa  159  9e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  34.67 
 
 
465 aa  159  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.53 
 
 
820 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.57 
 
 
822 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  30.26 
 
 
451 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  33.11 
 
 
472 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.46 
 
 
815 aa  157  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.81 
 
 
818 aa  157  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  29.95 
 
 
471 aa  156  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  28.49 
 
 
878 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  31.77 
 
 
478 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  30.58 
 
 
459 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0905  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.55 
 
 
821 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.87 
 
 
835 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  33.44 
 
 
468 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>