More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0401 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  100 
 
 
462 aa  938    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0087  aspartate kinase  70.65 
 
 
465 aa  634    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0531987  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  69.05 
 
 
462 aa  624  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  63.62 
 
 
465 aa  588  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  59.69 
 
 
463 aa  531  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  51.2 
 
 
465 aa  458  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  51.53 
 
 
472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1980  aspartate kinase  48.81 
 
 
469 aa  422  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0255525  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  45.24 
 
 
468 aa  394  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  42.61 
 
 
465 aa  365  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  43.6 
 
 
468 aa  364  1e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  43.6 
 
 
468 aa  363  3e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  45.92 
 
 
467 aa  363  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  42.95 
 
 
468 aa  359  5e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  42.95 
 
 
823 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  46.21 
 
 
467 aa  345  7e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  39.09 
 
 
467 aa  345  8e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1127  aspartate kinase  43.94 
 
 
470 aa  345  8e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.892413  hitchhiker  0.00887106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.92 
 
 
817 aa  335  7e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  41.06 
 
 
823 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  41.88 
 
 
819 aa  330  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  41.23 
 
 
478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  39.27 
 
 
818 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1820  aspartate kinase  41.94 
 
 
466 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000320312  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.96 
 
 
819 aa  316  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.57 
 
 
818 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.93 
 
 
815 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  37.09 
 
 
468 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  37.74 
 
 
814 aa  293  7e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.13 
 
 
820 aa  292  8e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.74 
 
 
822 aa  291  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  38.15 
 
 
541 aa  290  4e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.82 
 
 
819 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.94 
 
 
815 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.6 
 
 
815 aa  282  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  37.31 
 
 
815 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  38.71 
 
 
471 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.72 
 
 
835 aa  274  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.93 
 
 
834 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.07 
 
 
835 aa  267  4e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  38.6 
 
 
456 aa  266  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22113  bifunctional aspartokinase  36.04 
 
 
870 aa  265  8.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  37.98 
 
 
471 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.57 
 
 
818 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  37.34 
 
 
471 aa  259  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  35.57 
 
 
469 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.09 
 
 
819 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.55 
 
 
835 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.09 
 
 
819 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.65 
 
 
818 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  35.18 
 
 
463 aa  256  5e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  37.37 
 
 
471 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.13 
 
 
819 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  37.34 
 
 
471 aa  249  6e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.78 
 
 
819 aa  249  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.35 
 
 
819 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  33.7 
 
 
820 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  33.7 
 
 
820 aa  247  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  33.7 
 
 
820 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.7 
 
 
820 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.7 
 
 
818 aa  247  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726282  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.7 
 
 
820 aa  247  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.7 
 
 
820 aa  247  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.7 
 
 
820 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.7 
 
 
820 aa  247  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  34.35 
 
 
819 aa  247  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.2 
 
 
821 aa  246  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  35.83 
 
 
471 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.48 
 
 
822 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  34.39 
 
 
446 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  37.12 
 
 
471 aa  243  6e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.99 
 
 
819 aa  243  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.99 
 
 
819 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.27 
 
 
822 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.99 
 
 
819 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.7 
 
 
822 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.48 
 
 
822 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.48 
 
 
822 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.48 
 
 
822 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.05 
 
 
822 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.27 
 
 
822 aa  240  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.04 
 
 
820 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.55 
 
 
820 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.55 
 
 
820 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.55 
 
 
820 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.55 
 
 
820 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1494  aspartate kinase  32.06 
 
 
804 aa  236  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.55 
 
 
820 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.12 
 
 
822 aa  236  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16870  predicted protein  34.2 
 
 
810 aa  236  9e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254094  normal  0.0243125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3005  aspartate kinase  33.55 
 
 
469 aa  233  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.84 
 
 
821 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0564  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.33 
 
 
820 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2031  aspartate kinase  32.33 
 
 
469 aa  230  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.296392 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.83 
 
 
819 aa  229  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1079  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.92 
 
 
822 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.555098 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.18 
 
 
820 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1066  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.4 
 
 
821 aa  227  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2740  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.47 
 
 
825 aa  226  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03328  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.7 
 
 
804 aa  226  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>