More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004457 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.03 
 
 
819 aa  1052    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.95 
 
 
820 aa  1038    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  62.07 
 
 
820 aa  1035    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.07 
 
 
820 aa  1035    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  62.2 
 
 
820 aa  1035    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  83.76 
 
 
819 aa  1417    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1066  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.58 
 
 
821 aa  938    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56 
 
 
822 aa  941    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4291  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.87 
 
 
825 aa  881    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0564  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.44 
 
 
820 aa  1016    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  96.58 
 
 
819 aa  1593    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.99 
 
 
822 aa  952    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.03 
 
 
819 aa  1052    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.2 
 
 
820 aa  1036    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.64 
 
 
818 aa  1049    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.2 
 
 
820 aa  1044    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.07 
 
 
820 aa  1035    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  63.37 
 
 
819 aa  1063    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.07 
 
 
820 aa  1043    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  63.08 
 
 
819 aa  1059    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  100 
 
 
819 aa  1676    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.15 
 
 
819 aa  1054    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.07 
 
 
820 aa  1044    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  63.13 
 
 
818 aa  1057    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2740  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.9 
 
 
825 aa  941    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363981  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  85.47 
 
 
819 aa  1406    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  63.2 
 
 
819 aa  1060    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03328  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.38 
 
 
804 aa  915    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.95 
 
 
820 aa  922    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.51 
 
 
822 aa  935    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1214  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  57.62 
 
 
816 aa  910    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.07 
 
 
820 aa  1035    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.74 
 
 
822 aa  947    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.99 
 
 
822 aa  948    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.58 
 
 
821 aa  927    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.2 
 
 
821 aa  935    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  62.07 
 
 
820 aa  1035    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.86 
 
 
822 aa  948    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.64 
 
 
822 aa  939    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1270  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.07 
 
 
821 aa  926    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.739227  hitchhiker  0.00698149 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0905  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.25 
 
 
821 aa  894    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  60.47 
 
 
820 aa  1045    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.86 
 
 
818 aa  1028    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726282  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.64 
 
 
822 aa  937    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1079  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.88 
 
 
822 aa  936    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.555098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.64 
 
 
822 aa  938    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.07 
 
 
820 aa  1042    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.95 
 
 
820 aa  1034    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  40.15 
 
 
823 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39 
 
 
817 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  37.06 
 
 
818 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.43 
 
 
835 aa  561  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.6 
 
 
815 aa  559  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.31 
 
 
835 aa  557  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.59 
 
 
818 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  37.27 
 
 
814 aa  554  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.76 
 
 
823 aa  555  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.31 
 
 
835 aa  549  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.88 
 
 
815 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.77 
 
 
822 aa  529  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.93 
 
 
815 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.85 
 
 
819 aa  523  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.04 
 
 
819 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.8 
 
 
820 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.9 
 
 
834 aa  514  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16870  predicted protein  38.49 
 
 
810 aa  515  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254094  normal  0.0243125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.44 
 
 
819 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  36.55 
 
 
815 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0411  aspartate kinase  32.97 
 
 
804 aa  455  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.204569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1494  aspartate kinase  32.81 
 
 
804 aa  442  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2257  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.33 
 
 
803 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4045  aspartate kinase  32.36 
 
 
810 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4382  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.36 
 
 
810 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.810334 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4426  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.36 
 
 
810 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5400  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.36 
 
 
810 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.324557 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4174  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.36 
 
 
810 aa  368  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4075  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.36 
 
 
810 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4480  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.36 
 
 
810 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.27821  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0190  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.68 
 
 
811 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4034  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.97 
 
 
810 aa  365  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.522954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03826  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.24 
 
 
810 aa  363  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.087529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03775  hypothetical protein  32.24 
 
 
810 aa  363  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0902999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0537  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.2 
 
 
797 aa  363  6e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0122  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.2 
 
 
811 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3806  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.2 
 
 
811 aa  362  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4094  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.2 
 
 
811 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3775  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.04 
 
 
797 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0561  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.08 
 
 
797 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0565  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.96 
 
 
797 aa  360  7e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3438  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.59 
 
 
797 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0513  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.83 
 
 
797 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3613  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.83 
 
 
797 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4318  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.57 
 
 
810 aa  358  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0617  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.55 
 
 
797 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0121  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.32 
 
 
811 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4348  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.45 
 
 
810 aa  356  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4502  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.45 
 
 
810 aa  356  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4432  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.32 
 
 
810 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4435  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.36 
 
 
810 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.941973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4785  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.48 
 
 
811 aa  355  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>