More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4291 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.22 
 
 
820 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  55.22 
 
 
820 aa  897    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  55.22 
 
 
820 aa  897    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  55.22 
 
 
820 aa  897    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.56 
 
 
819 aa  893    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.43 
 
 
819 aa  891    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.65 
 
 
818 aa  911    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.1 
 
 
820 aa  895    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4291  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  100 
 
 
825 aa  1707    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.59 
 
 
822 aa  894    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.94 
 
 
821 aa  885    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.22 
 
 
820 aa  897    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.74 
 
 
819 aa  926    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.41 
 
 
819 aa  907    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.83 
 
 
822 aa  906    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03328  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  57.32 
 
 
804 aa  913    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.95 
 
 
822 aa  909    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.22 
 
 
820 aa  900    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.46 
 
 
818 aa  904    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2740  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.9 
 
 
825 aa  892    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1270  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.33 
 
 
821 aa  884    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.739227  hitchhiker  0.00698149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.22 
 
 
820 aa  897    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.1 
 
 
820 aa  898    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.22 
 
 
820 aa  897    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  58.42 
 
 
820 aa  944    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1214  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  51.09 
 
 
816 aa  810    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.71 
 
 
822 aa  904    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.83 
 
 
822 aa  903    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.83 
 
 
822 aa  902    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1066  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.93 
 
 
821 aa  903    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.43 
 
 
819 aa  891    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.39 
 
 
821 aa  892    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.62 
 
 
819 aa  918    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.83 
 
 
822 aa  905    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0905  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.3 
 
 
821 aa  853    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  56.87 
 
 
819 aa  933    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.6 
 
 
820 aa  894    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.14 
 
 
819 aa  931    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.1 
 
 
820 aa  897    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.22 
 
 
820 aa  896    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.22 
 
 
820 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.99 
 
 
818 aa  890    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726282  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  54.71 
 
 
822 aa  902    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.74 
 
 
819 aa  917    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0564  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.46 
 
 
820 aa  864    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.29 
 
 
819 aa  925    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1079  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.33 
 
 
822 aa  920    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.555098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.07 
 
 
822 aa  910    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  40.07 
 
 
817 aa  592  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  38.36 
 
 
823 aa  562  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.46 
 
 
823 aa  545  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.55 
 
 
820 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  35.61 
 
 
818 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.94 
 
 
819 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.35 
 
 
835 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.26 
 
 
819 aa  528  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.59 
 
 
835 aa  527  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.9 
 
 
819 aa  525  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.57 
 
 
835 aa  525  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.69 
 
 
822 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  35.86 
 
 
814 aa  518  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.34 
 
 
815 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.39 
 
 
815 aa  515  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16870  predicted protein  37.99 
 
 
810 aa  514  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254094  normal  0.0243125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.35 
 
 
815 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  35.07 
 
 
815 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.14 
 
 
818 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.77 
 
 
834 aa  488  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0411  aspartate kinase  33.73 
 
 
804 aa  437  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.204569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1494  aspartate kinase  33.17 
 
 
804 aa  435  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22113  bifunctional aspartokinase  32.25 
 
 
870 aa  347  5e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2257  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.51 
 
 
803 aa  342  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4034  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.01 
 
 
810 aa  340  9e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.522954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0122  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.16 
 
 
811 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4094  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.16 
 
 
811 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3806  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.16 
 
 
811 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4382  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.15 
 
 
810 aa  336  9e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.810334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0190  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.65 
 
 
811 aa  336  9e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4045  aspartate kinase  29.15 
 
 
810 aa  336  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4480  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.15 
 
 
810 aa  336  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.27821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4075  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.15 
 
 
810 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4174  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.15 
 
 
810 aa  336  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4785  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.1 
 
 
811 aa  335  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5400  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.15 
 
 
810 aa  335  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.324557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4426  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.15 
 
 
810 aa  335  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0178  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.53 
 
 
811 aa  334  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03826  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.02 
 
 
810 aa  332  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.087529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03775  hypothetical protein  29.02 
 
 
810 aa  332  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0902999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0121  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.87 
 
 
811 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3790  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.78 
 
 
811 aa  330  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.395473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4318  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.74 
 
 
810 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4435  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.62 
 
 
810 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.941973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4502  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.74 
 
 
810 aa  328  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4348  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.74 
 
 
810 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4432  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.74 
 
 
810 aa  327  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002307  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  28.92 
 
 
802 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0561  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.79 
 
 
797 aa  317  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2748  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  28.76 
 
 
806 aa  317  8e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00048  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  28.36 
 
 
802 aa  315  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0521  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.25 
 
 
797 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>