More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2419 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  67.67 
 
 
471 aa  666    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  74.73 
 
 
471 aa  697    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  74.26 
 
 
471 aa  723    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  68.72 
 
 
471 aa  668    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  75.53 
 
 
471 aa  741    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  76.81 
 
 
471 aa  741    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  100 
 
 
471 aa  961    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  42.52 
 
 
469 aa  344  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  42.32 
 
 
456 aa  333  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  38.85 
 
 
455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  39.7 
 
 
458 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  39.91 
 
 
455 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  40.39 
 
 
454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  39.48 
 
 
458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  39.7 
 
 
449 aa  302  7.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  39.26 
 
 
461 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  39.05 
 
 
461 aa  299  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  38.83 
 
 
461 aa  298  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  39.36 
 
 
467 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  36.9 
 
 
818 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  35.48 
 
 
456 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.53 
 
 
817 aa  291  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  36.72 
 
 
451 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25490  aspartate kinase  43.44 
 
 
450 aa  291  2e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  39.79 
 
 
462 aa  289  8e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  37.39 
 
 
450 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  36.48 
 
 
468 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  38.1 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  38.68 
 
 
478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  38.82 
 
 
452 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  39.52 
 
 
449 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  39.52 
 
 
449 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  39.52 
 
 
449 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  39.52 
 
 
449 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  39.52 
 
 
449 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  37.12 
 
 
437 aa  280  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  36.01 
 
 
440 aa  280  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.52096 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  39.31 
 
 
449 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  39.31 
 
 
449 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  39.31 
 
 
449 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  39.31 
 
 
449 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  39.31 
 
 
449 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.92 
 
 
815 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  39.31 
 
 
449 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  39.31 
 
 
449 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  39.31 
 
 
449 aa  277  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1820  aspartate kinase  37.23 
 
 
466 aa  276  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000320312  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  38.46 
 
 
451 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  38.41 
 
 
456 aa  276  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  38.44 
 
 
450 aa  275  9e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  37.26 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  38.84 
 
 
467 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  38.25 
 
 
451 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  39.09 
 
 
449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  38.25 
 
 
451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  38.32 
 
 
451 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  38.22 
 
 
451 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  38.41 
 
 
459 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  38.32 
 
 
451 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  36.08 
 
 
468 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  37.98 
 
 
451 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  36.17 
 
 
468 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  36.08 
 
 
468 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  37.71 
 
 
451 aa  270  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  37.47 
 
 
465 aa  269  7e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  34.03 
 
 
814 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  35.15 
 
 
468 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  35.82 
 
 
465 aa  269  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  37.04 
 
 
446 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  35.74 
 
 
815 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_002950  PG2189  aspartate kinase  36.66 
 
 
446 aa  266  4e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  37.37 
 
 
462 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  37.37 
 
 
451 aa  264  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  36.02 
 
 
452 aa  262  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  35.14 
 
 
449 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  37.01 
 
 
823 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  39.35 
 
 
452 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.58 
 
 
815 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  35.41 
 
 
465 aa  259  9e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  38.01 
 
 
450 aa  256  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  35.61 
 
 
541 aa  256  9e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  35.9 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1127  aspartate kinase  37.5 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.892413  hitchhiker  0.00887106 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0087  aspartate kinase  37.71 
 
 
465 aa  254  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0531987  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.76 
 
 
818 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  35.86 
 
 
463 aa  251  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  35.14 
 
 
441 aa  249  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  31.03 
 
 
467 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1980  aspartate kinase  35.96 
 
 
469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0255525  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  35.83 
 
 
878 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.98 
 
 
818 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.11 
 
 
818 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.79 
 
 
819 aa  240  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.45 
 
 
819 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3425  aspartate kinase III  38.15 
 
 
452 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000055532  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08859  aspartate kinase, putative (Eurofung)  33.07 
 
 
525 aa  239  9e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.777655  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.84 
 
 
819 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  32.9 
 
 
859 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  34.45 
 
 
819 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  31.96 
 
 
444 aa  237  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>