More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3064 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3064  aspartate kinase  100 
 
 
421 aa  865    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5565  aspartate kinase  46.45 
 
 
414 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2925  aspartate kinase  44.21 
 
 
424 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102546  hitchhiker  0.00016365 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02310  lysine-sensitive aspartokinase III (aspartate kinase III)  42.76 
 
 
417 aa  378  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0535  aspartate kinase  42.28 
 
 
419 aa  362  5.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0283  aspartate kinase  42.28 
 
 
416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00335485  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0369  hypothetical protein  37 
 
 
427 aa  267  2e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  31.77 
 
 
823 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  31.7 
 
 
818 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  31.12 
 
 
471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  32.16 
 
 
450 aa  196  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.46 
 
 
817 aa  195  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  33.97 
 
 
450 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  32.99 
 
 
451 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  32.79 
 
 
456 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  30.92 
 
 
471 aa  189  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  30.61 
 
 
471 aa  186  8e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  31.66 
 
 
471 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  29.59 
 
 
471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  28.96 
 
 
471 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  31.15 
 
 
471 aa  176  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  31.75 
 
 
455 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1820  aspartate kinase  29.37 
 
 
466 aa  176  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000320312  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  29.57 
 
 
458 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  31.78 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  31.91 
 
 
451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  31.91 
 
 
451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.27 
 
 
818 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  28.89 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.76 
 
 
815 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  31.78 
 
 
461 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  31.78 
 
 
461 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  32.94 
 
 
467 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  31.91 
 
 
451 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  29.32 
 
 
458 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  32.33 
 
 
451 aa  172  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  31.41 
 
 
451 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  31.66 
 
 
451 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  31.41 
 
 
451 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  30.85 
 
 
541 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.02 
 
 
818 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  31.41 
 
 
451 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  31.41 
 
 
451 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  35.48 
 
 
465 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  33.44 
 
 
815 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.02 
 
 
818 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.23 
 
 
819 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  30.21 
 
 
469 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3005  aspartate kinase  32.47 
 
 
469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  32.24 
 
 
478 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.41 
 
 
819 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.49 
 
 
819 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.41 
 
 
819 aa  166  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.5 
 
 
819 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  34.6 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  34.29 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  34.6 
 
 
468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  30.9 
 
 
449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  31.9 
 
 
468 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  32.52 
 
 
462 aa  163  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.67 
 
 
834 aa  162  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.1 
 
 
819 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  30.21 
 
 
467 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  32.69 
 
 
463 aa  160  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  30.08 
 
 
814 aa  160  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  30.75 
 
 
454 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.94 
 
 
835 aa  159  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  30.58 
 
 
452 aa  159  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.4 
 
 
819 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  29.95 
 
 
819 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.4 
 
 
819 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  31.02 
 
 
452 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.4 
 
 
819 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.54 
 
 
820 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2031  aspartate kinase  31.68 
 
 
469 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.296392 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.54 
 
 
820 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  29.82 
 
 
450 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  29.93 
 
 
449 aa  157  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  28.29 
 
 
820 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  28.29 
 
 
820 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.29 
 
 
820 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  28.29 
 
 
820 aa  156  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.29 
 
 
820 aa  156  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.57 
 
 
819 aa  156  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.23 
 
 
815 aa  156  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.53 
 
 
823 aa  156  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.29 
 
 
820 aa  156  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.03 
 
 
822 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  28.93 
 
 
441 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  29.68 
 
 
868 aa  155  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.38 
 
 
819 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  30.17 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  29.97 
 
 
449 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28 
 
 
820 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  29.97 
 
 
449 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  29.97 
 
 
449 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28 
 
 
820 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28 
 
 
820 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  30.15 
 
 
449 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  29.97 
 
 
449 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>