More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3986 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  94.9 
 
 		 451 aa  848    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  100 
 
 		 451 aa  914    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  79.51 
 
 		 456 aa  692    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  77.73 
 
 		 449 aa  679    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  95.12 
 
 		 451 aa  853    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  95.12 
 
 		 451 aa  850    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  98.45 
 
 		 451 aa  902    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  98.23 
 
 		 451 aa  899    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  85.23 
 
 		 459 aa  729    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  83.74 
 
 		 450 aa  754    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  98.45 
 
 		 451 aa  902    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  84.67 
 
 		 452 aa  761    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  94.9 
 
 		 451 aa  849    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  85.33 
 
 		 450 aa  748    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  83.37 
 
 		 452 aa  727    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  96.45 
 
 		 451 aa  862    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  59.91 
 
 		 455 aa  535  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  59.15 
 
 		 454 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  58.48 
 
 		 458 aa  529  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  60.04 
 
 		 455 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  58.07 
 
 		 458 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  57.98 
 
 		 451 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  58.71 
 
 		 449 aa  511  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  56.4 
 
 		 450 aa  504  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  56.4 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  60.63 
 
 		 449 aa  495  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  58.07 
 
 		 461 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  58.07 
 
 		 461 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  60.4 
 
 		 449 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  60.4 
 
 		 449 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  60.4 
 
 		 449 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  57.85 
 
 		 461 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  60.4 
 
 		 449 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  60.4 
 
 		 449 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  60.63 
 
 		 449 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  60.4 
 
 		 449 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  60.18 
 
 		 449 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  60.18 
 
 		 449 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  60.18 
 
 		 449 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  60.18 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  60.18 
 
 		 449 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  59.96 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  52.01 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  52.55 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3425  aspartate kinase III  51.33 
 
 		 452 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000055532  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  37.66 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  37.02 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  35.97 
 
 		 471 aa  280  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  38.89 
 
 		 469 aa  279  9e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  37.2 
 
 		 471 aa  277  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  37.12 
 
 		 471 aa  272  8.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  36.97 
 
 		 471 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  37.71 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  38.43 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  34.15 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  34.73 
 
 		 452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  33.05 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  34.78 
 
 		 541 aa  237  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  33.85 
 
 		 441 aa  236  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.67 
 
 		 815 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  34.99 
 
 		 823 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25490  aspartate kinase  40.95 
 
 		 450 aa  231  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.91 
 
 		 817 aa  230  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  32.53 
 
 		 437 aa  229  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  33.47 
 
 		 468 aa  226  9e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  34.2 
 
 		 814 aa  224  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.05 
 
 		 815 aa  221  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  33.19 
 
 		 465 aa  219  6e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  35.13 
 
 		 467 aa  216  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  34.19 
 
 		 878 aa  216  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  30.8 
 
 		 818 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  32.69 
 
 		 859 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  34.19 
 
 		 478 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  34.12 
 
 		 462 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  32.33 
 
 		 859 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2189  aspartate kinase  30.99 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  32.56 
 
 		 472 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  35.89 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.77 
 
 		 822 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.98 
 
 		 822 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.77 
 
 		 822 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  34.34 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  32.62 
 
 		 467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.29 
 
 		 822 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.77 
 
 		 822 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  31.74 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.01 
 
 		 822 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31 
 
 		 822 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.44 
 
 		 822 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  33.33 
 
 		 463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.67 
 
 		 821 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  33.05 
 
 		 857 aa  196  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  33.19 
 
 		 868 aa  196  6e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  30.93 
 
 		 815 aa  196  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.06 
 
 		 822 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.78 
 
 		 818 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.32 
 
 		 823 aa  194  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  33.19 
 
 		 868 aa  194  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  30.88 
 
 		 465 aa  193  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  32.18 
 
 		 819 aa  193  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>