More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0372 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  81.61 
 
 
449 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  82.02 
 
 
461 aa  734    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  82.37 
 
 
449 aa  704    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  82.37 
 
 
449 aa  704    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  100 
 
 
454 aa  920    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  80.58 
 
 
449 aa  728    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  81.61 
 
 
449 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  82.14 
 
 
449 aa  700    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  81.61 
 
 
449 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  82.37 
 
 
449 aa  704    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  82.25 
 
 
461 aa  736    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  81.61 
 
 
449 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  82.37 
 
 
449 aa  704    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  80.75 
 
 
455 aa  741    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  82.37 
 
 
449 aa  704    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  87.89 
 
 
458 aa  806    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  82.37 
 
 
449 aa  704    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  81.61 
 
 
449 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  82.37 
 
 
449 aa  704    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  91.43 
 
 
455 aa  839    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  82.37 
 
 
449 aa  704    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  82.02 
 
 
461 aa  734    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  88.33 
 
 
458 aa  810    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  59.6 
 
 
451 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  59.6 
 
 
451 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  59.6 
 
 
452 aa  523  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  59.15 
 
 
451 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  59.38 
 
 
451 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  59.38 
 
 
451 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  58.93 
 
 
451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  58.93 
 
 
451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  58.93 
 
 
451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  58.93 
 
 
451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  58.04 
 
 
450 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  55.73 
 
 
451 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  56.26 
 
 
456 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  55.06 
 
 
450 aa  488  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  58.39 
 
 
459 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  54.83 
 
 
450 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  58.48 
 
 
452 aa  491  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  57.81 
 
 
450 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  55.8 
 
 
449 aa  483  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  49.56 
 
 
456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  46.68 
 
 
449 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3425  aspartate kinase III  46.12 
 
 
452 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000055532  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  37.53 
 
 
471 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  39.19 
 
 
471 aa  296  5e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  40.39 
 
 
471 aa  296  6e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  38.23 
 
 
471 aa  291  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  38.08 
 
 
471 aa  289  7e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  38.2 
 
 
471 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  36.73 
 
 
471 aa  276  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  37.28 
 
 
469 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  35.5 
 
 
456 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  33.63 
 
 
441 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  33.33 
 
 
440 aa  243  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  34.15 
 
 
444 aa  242  9e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  33.48 
 
 
437 aa  239  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  33.33 
 
 
452 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  33.04 
 
 
541 aa  226  6e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  32.29 
 
 
818 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.91 
 
 
859 aa  220  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2189  aspartate kinase  31.8 
 
 
446 aa  218  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.7 
 
 
859 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.83 
 
 
817 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  33.91 
 
 
878 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.4 
 
 
815 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25490  aspartate kinase  36.29 
 
 
450 aa  212  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.3 
 
 
864 aa  209  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  32.31 
 
 
823 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  32.26 
 
 
868 aa  209  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.62 
 
 
868 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  32.25 
 
 
478 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  31.89 
 
 
814 aa  204  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.97 
 
 
818 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.13 
 
 
815 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  33.48 
 
 
463 aa  200  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  32.04 
 
 
467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  32.02 
 
 
446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  30.93 
 
 
850 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  32.61 
 
 
462 aa  196  9e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  31.92 
 
 
472 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  30.02 
 
 
857 aa  191  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0535  aspartate kinase  29.65 
 
 
419 aa  190  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  29.53 
 
 
465 aa  186  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.47 
 
 
823 aa  186  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  32.65 
 
 
467 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02310  lysine-sensitive aspartokinase III (aspartate kinase III)  30.14 
 
 
417 aa  186  9e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.37 
 
 
820 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  29.81 
 
 
468 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5565  aspartate kinase  30.43 
 
 
414 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.64 
 
 
819 aa  182  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  28.39 
 
 
468 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  29.79 
 
 
815 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  29.74 
 
 
819 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  28.39 
 
 
465 aa  182  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.82 
 
 
820 aa  179  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2740  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.7 
 
 
825 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363981  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.63 
 
 
822 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30 
 
 
819 aa  176  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>