More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5565 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5565  aspartate kinase  100 
 
 
414 aa  849    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2925  aspartate kinase  54.52 
 
 
424 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102546  hitchhiker  0.00016365 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0535  aspartate kinase  49.76 
 
 
419 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02310  lysine-sensitive aspartokinase III (aspartate kinase III)  51.8 
 
 
417 aa  423  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3064  aspartate kinase  46.45 
 
 
421 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0283  aspartate kinase  49.64 
 
 
416 aa  375  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00335485  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0369  hypothetical protein  33.49 
 
 
427 aa  265  1e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.43 
 
 
819 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  30.94 
 
 
471 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  32.35 
 
 
471 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.52 
 
 
819 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  37.58 
 
 
823 aa  189  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.87 
 
 
819 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  30.63 
 
 
458 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  30.43 
 
 
454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  32.87 
 
 
819 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  32.63 
 
 
471 aa  182  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  30.43 
 
 
458 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.7 
 
 
815 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  29.67 
 
 
455 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  32.1 
 
 
469 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  32.28 
 
 
471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  32.75 
 
 
471 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.58 
 
 
822 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  31.77 
 
 
465 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  30.28 
 
 
449 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  29.82 
 
 
818 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.33 
 
 
822 aa  169  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  36.24 
 
 
468 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.33 
 
 
822 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.01 
 
 
822 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  32.16 
 
 
449 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  30.83 
 
 
471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.71 
 
 
820 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  32.71 
 
 
857 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0905  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.7 
 
 
821 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  35.91 
 
 
468 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  35.91 
 
 
468 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  31.18 
 
 
471 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  30.62 
 
 
461 aa  166  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  34.65 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  30.62 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  30.62 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  35.69 
 
 
814 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.24 
 
 
818 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  30.03 
 
 
450 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1494  aspartate kinase  31.97 
 
 
804 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.51 
 
 
822 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.58 
 
 
819 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.51 
 
 
822 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.51 
 
 
822 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  31.07 
 
 
455 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.02 
 
 
818 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.27 
 
 
822 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.25 
 
 
819 aa  162  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  28.07 
 
 
456 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.68 
 
 
823 aa  162  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.81 
 
 
819 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  29.41 
 
 
450 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.82 
 
 
822 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.02 
 
 
835 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.12 
 
 
819 aa  160  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.52 
 
 
819 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.52 
 
 
819 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.52 
 
 
819 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.48 
 
 
819 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  29 
 
 
859 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  28.8 
 
 
541 aa  160  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.94 
 
 
821 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.48 
 
 
819 aa  159  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.13 
 
 
818 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.33 
 
 
835 aa  159  9e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  29.04 
 
 
441 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.46 
 
 
835 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  30.73 
 
 
449 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  30.73 
 
 
449 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.33 
 
 
817 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  30.73 
 
 
449 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  30.2 
 
 
437 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  30.19 
 
 
451 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  30.73 
 
 
449 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  30.73 
 
 
449 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  31.46 
 
 
449 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  31.46 
 
 
449 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  31.46 
 
 
449 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  30.73 
 
 
449 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  30.73 
 
 
449 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  31.46 
 
 
449 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  30.73 
 
 
449 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0411  aspartate kinase  33.43 
 
 
804 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.204569  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.2 
 
 
820 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  30.64 
 
 
467 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.2 
 
 
820 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  31.46 
 
 
449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.2 
 
 
820 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.87 
 
 
820 aa  156  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  28.77 
 
 
859 aa  156  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4291  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.87 
 
 
825 aa  155  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  29.67 
 
 
452 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.2 
 
 
820 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>