More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2925 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2925  aspartate kinase  100 
 
 		 424 aa  876    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102546  hitchhiker  0.00016365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5565  aspartate kinase  54.52 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0535  aspartate kinase  47.38 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02310  lysine-sensitive aspartokinase III (aspartate kinase III)  44.39 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3064  aspartate kinase  44.21 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0283  aspartate kinase  44.87 
 
 		 416 aa  364  2e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00335485  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0369  hypothetical protein  35.24 
 
 		 427 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  32.08 
 
 		 823 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  30.79 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  30.96 
 
 		 471 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  32.02 
 
 		 450 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  32.02 
 
 		 450 aa  187  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  31.87 
 
 		 456 aa  186  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  30.35 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  32.39 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  31.27 
 
 		 471 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  31.27 
 
 		 471 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  33.99 
 
 		 818 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  31.99 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.66 
 
 		 815 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  35.71 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  35.39 
 
 		 468 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  35.39 
 
 		 468 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  27.66 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  28.89 
 
 		 471 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  35.06 
 
 		 468 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  27.66 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.44 
 
 		 817 aa  173  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  29.65 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  27.16 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  28.79 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  29.78 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  35.23 
 
 		 467 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  30.14 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.61 
 
 		 819 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  31.78 
 
 		 471 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.11 
 
 		 818 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.1 
 
 		 823 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.73 
 
 		 820 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  29.59 
 
 		 452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  28.89 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  28.69 
 
 		 461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  29.93 
 
 		 859 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  29.43 
 
 		 819 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.82 
 
 		 815 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  34.65 
 
 		 814 aa  164  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  29.93 
 
 		 859 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  28.69 
 
 		 461 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.43 
 
 		 819 aa  163  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  29.01 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  34.46 
 
 		 478 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  29.01 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  28.41 
 
 		 461 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.05 
 
 		 820 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  28.05 
 
 		 820 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.62 
 
 		 819 aa  160  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  28.05 
 
 		 820 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.05 
 
 		 820 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  28.05 
 
 		 820 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  29.01 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.05 
 
 		 820 aa  160  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.05 
 
 		 820 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  26.33 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.05 
 
 		 820 aa  159  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.38 
 
 		 819 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30 
 
 		 834 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.08 
 
 		 835 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  28.57 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  31.12 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.33 
 
 		 820 aa  159  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  28.57 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  28.57 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  28.57 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  28.57 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.08 
 
 		 835 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  28.06 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  28.06 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  28.06 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  29.01 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  28.06 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  28.06 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  33.9 
 
 		 815 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2031  aspartate kinase  32.46 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  29.08 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  29.85 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.54 
 
 		 819 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  28.06 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  28.06 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  33.73 
 
 		 462 aa  157  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  28.06 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  33.56 
 
 		 462 aa  156  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.68 
 
 		 818 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  27.83 
 
 		 878 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0564  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29 
 
 		 820 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.08 
 
 		 835 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  33.22 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  28.8 
 
 		 449 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  28.75 
 
 		 451 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  28.5 
 
 		 451 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  27.81 
 
 		 449 aa  153  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.193511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>