More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3764 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  84.44 
 
 		 451 aa  764    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  84.67 
 
 		 451 aa  768    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  92.87 
 
 		 450 aa  827    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  85.33 
 
 		 451 aa  767    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  100 
 
 		 450 aa  916    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  82 
 
 		 456 aa  711    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  75.95 
 
 		 449 aa  674    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  85.56 
 
 		 451 aa  770    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  85.78 
 
 		 451 aa  773    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  82.55 
 
 		 459 aa  717    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  85.56 
 
 		 451 aa  770    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  83.78 
 
 		 452 aa  751    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  85.52 
 
 		 451 aa  771    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  84.22 
 
 		 451 aa  764    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  86.89 
 
 		 452 aa  759    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  84.22 
 
 		 451 aa  763    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  58.35 
 
 		 455 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  58.43 
 
 		 451 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  57.14 
 
 		 458 aa  520  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  57.81 
 
 		 454 aa  521  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  58.48 
 
 		 455 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  56.73 
 
 		 458 aa  514  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  56.4 
 
 		 450 aa  510  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  56.18 
 
 		 450 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  57.37 
 
 		 449 aa  500  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  56.95 
 
 		 461 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  56.73 
 
 		 461 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  56.5 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  58.17 
 
 		 449 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  58.17 
 
 		 449 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  57.94 
 
 		 449 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  57.94 
 
 		 449 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  57.94 
 
 		 449 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  57.94 
 
 		 449 aa  471  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  57.94 
 
 		 449 aa  471  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  58.17 
 
 		 449 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  57.94 
 
 		 449 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  57.72 
 
 		 449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  57.94 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  57.94 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  57.94 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  57.72 
 
 		 449 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  51.1 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  50.55 
 
 		 449 aa  431  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3425  aspartate kinase III  51.55 
 
 		 452 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000055532  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  36.21 
 
 		 471 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  36.75 
 
 		 471 aa  279  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  36.72 
 
 		 471 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  37.27 
 
 		 471 aa  277  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  38.68 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  38.01 
 
 		 471 aa  273  6e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  36.99 
 
 		 471 aa  272  8.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  37.47 
 
 		 471 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  35.4 
 
 		 452 aa  257  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  34.82 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  37.8 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  34.66 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  35.7 
 
 		 541 aa  245  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  34.06 
 
 		 437 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  35.81 
 
 		 441 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.2 
 
 		 817 aa  237  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.33 
 
 		 815 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  36.3 
 
 		 823 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25490  aspartate kinase  40.04 
 
 		 450 aa  227  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  33.48 
 
 		 814 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  32.47 
 
 		 818 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.62 
 
 		 815 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  32.62 
 
 		 859 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  31.97 
 
 		 465 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  31.89 
 
 		 468 aa  211  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.07 
 
 		 822 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.86 
 
 		 822 aa  210  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  33.4 
 
 		 472 aa  209  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  34.34 
 
 		 467 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  33.99 
 
 		 878 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.86 
 
 		 822 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  32.7 
 
 		 859 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.01 
 
 		 822 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  34.12 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.22 
 
 		 822 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.86 
 
 		 822 aa  203  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.01 
 
 		 822 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.34 
 
 		 822 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.01 
 
 		 822 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  34.54 
 
 		 478 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  31.62 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  32.83 
 
 		 868 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  33.26 
 
 		 868 aa  199  9e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  33.91 
 
 		 864 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  32.06 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  36.91 
 
 		 467 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_002950  PG2189  aspartate kinase  30.28 
 
 		 446 aa  196  6e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.61 
 
 		 835 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.01 
 
 		 823 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.7 
 
 		 834 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.85 
 
 		 821 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.55 
 
 		 818 aa  192  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.5 
 
 		 818 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  31.77 
 
 		 819 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.68 
 
 		 819 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>