179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0642 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  431  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.46 
 
 
210 aa  254  6e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.94 
 
 
210 aa  250  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0909  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  57.97 
 
 
210 aa  232  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000543789 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2093  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.67 
 
 
212 aa  230  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0066  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.95 
 
 
207 aa  174  9e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0596395  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0227  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.46 
 
 
208 aa  157  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000023759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.11 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.61 
 
 
192 aa  82  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.48 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.65 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.27 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.23 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.94 
 
 
428 aa  72.4  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.8 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.1 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  26.29 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.06 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.38 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.5 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.55 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.62 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.57 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.76 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  28.04 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  30.06 
 
 
177 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.38 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.56 
 
 
204 aa  62  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.27 
 
 
193 aa  61.6  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.01 
 
 
425 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.62 
 
 
201 aa  58.2  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.26 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.47 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.52 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1342  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.51 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.83 
 
 
200 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.06 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.55 
 
 
198 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.08 
 
 
372 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  33.72 
 
 
359 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.37 
 
 
223 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.78 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.76 
 
 
319 aa  55.1  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.16 
 
 
507 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0840  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.99 
 
 
218 aa  54.7  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.93 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.48 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  21.92 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0358  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.65 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0166511  normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14950  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  32.29 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.41 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
231 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
231 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
231 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.32 
 
 
190 aa  52  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  33.9 
 
 
233 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.84 
 
 
219 aa  51.6  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0881  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.84 
 
 
206 aa  51.6  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26 
 
 
205 aa  51.6  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.96 
 
 
191 aa  51.6  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  51.2  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.22 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.31 
 
 
530 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.49 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.22 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.58 
 
 
410 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.21 
 
 
396 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.57 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.63 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.22 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.22 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.32 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.46 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.46 
 
 
276 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  25.34 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2405  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.94 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.67 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.46 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.46 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.46 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.46 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.46 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 
685 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.31 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.88 
 
 
397 aa  48.5  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.49 
 
 
211 aa  48.5  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 
315 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.49 
 
 
211 aa  48.5  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.42 
 
 
195 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.42 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2273  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  41.27 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
299 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
299 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.73 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.42 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15400  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.9 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0253477  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.41 
 
 
655 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>