More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0265 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  298  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  78.1 
 
 		 144 aa  223  7e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  71.83 
 
 		 143 aa  213  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  72.26 
 
 		 144 aa  211  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  72.26 
 
 		 142 aa  210  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  80.8 
 
 		 129 aa  210  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  70.63 
 
 		 145 aa  207  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  71.94 
 
 		 149 aa  207  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  76.03 
 
 		 127 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  74.36 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  72.65 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  68.09 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  70.94 
 
 		 124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  69.42 
 
 		 123 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  62.02 
 
 		 138 aa  173  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  63.28 
 
 		 146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  62.5 
 
 		 131 aa  167  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  62.3 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.91 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  62.5 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  64.96 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  64.1 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  57.72 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  68.85 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  63.03 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  58.87 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  57.26 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  58.14 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  63.2 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  62.4 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.85 
 
 		 291 aa  147  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  53.85 
 
 		 291 aa  147  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  55.93 
 
 		 312 aa  144  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  57.81 
 
 		 153 aa  143  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.56 
 
 		 283 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.07 
 
 		 277 aa  143  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  60 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.93 
 
 		 286 aa  142  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  57.03 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  58.4 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  57.03 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  58.4 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  57.48 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  59.2 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  59.2 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  59.2 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  59.2 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.85 
 
 		 298 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  59.2 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  58.4 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.56 
 
 		 133 aa  141  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.46 
 
 		 207 aa  140  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  57.14 
 
 		 127 aa  140  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  58.4 
 
 		 128 aa  140  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.56 
 
 		 133 aa  141  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.93 
 
 		 284 aa  140  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.48 
 
 		 134 aa  140  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.93 
 
 		 284 aa  140  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  56 
 
 		 139 aa  140  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  56.69 
 
 		 135 aa  140  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.56 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  56.35 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.24 
 
 		 277 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  56.45 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  57.6 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.6 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.39 
 
 		 344 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  51.88 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.6 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  55.2 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  56 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  56.35 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  55.2 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  55.2 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  56 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  55.2 
 
 		 133 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  54.76 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0409  scaffold protein  56.1 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  57.72 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  55.83 
 
 		 135 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  57.48 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  57.48 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  56.35 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.24 
 
 		 309 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  56.35 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.6 
 
 		 135 aa  137  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  52.5 
 
 		 139 aa  137  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  55.37 
 
 		 133 aa  137  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  56.35 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  56.35 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  54.33 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  60 
 
 		 125 aa  137  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  56.35 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.97 
 
 		 133 aa  137  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  57.72 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  53.6 
 
 		 138 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  56.35 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  56.35 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  55 
 
 		 135 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  56.35 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>