145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0113 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0113  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  684    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0968389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  35.07 
 
 		 363 aa  205  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2465  protein of unknown function UPF0118  29.71 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1259  protein of unknown function UPF0118  29.65 
 
 		 345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.324845  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1366  hypothetical protein  32.56 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3764  protein of unknown function UPF0118  26.89 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2097  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.987772  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1144  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1581  protein of unknown function UPF0118  28.08 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0769558 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  24 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  22.42 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  20.74 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  21.67 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  23.01 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  24.6 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  24.72 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  24.5 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  24.25 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  22.4 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  20.85 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  21.59 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  21.59 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  21.31 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  27.45 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  23.47 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  23.67 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  32.06 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  33.59 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  20.39 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  24.68 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  24.61 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  23.83 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  24.71 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  23.83 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  23.83 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  24.22 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  20.55 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  21.02 
 
 		 358 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  35.34 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  21.97 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  24.32 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  25.76 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  23.64 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  22.35 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  30.63 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  25.12 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  22.71 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  26.7 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  23.19 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  24.8 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  24.8 
 
 		 374 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  21.97 
 
 		 368 aa  53.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  24.8 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  24.8 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  24.8 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  24.8 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  24.8 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  28 
 
 		 358 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  24.6 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  24.39 
 
 		 361 aa  52.8  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  30.77 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  27.2 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  22.69 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  24.87 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  27.66 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  28.57 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  22.58 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  23.62 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  28.65 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  28.25 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  28.25 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11122  hypothetical protein  23.44 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  28.36 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  22.6 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  32.82 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  30.37 
 
 		 396 aa  49.7  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  30 
 
 		 398 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  29.51 
 
 		 360 aa  49.7  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  25.99 
 
 		 358 aa  49.3  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  27.54 
 
 		 355 aa  49.3  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  27.54 
 
 		 369 aa  49.3  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  31.3 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  24.14 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  28.69 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  26.15 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  28.69 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  25.53 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  28.69 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  27.54 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  28.69 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  28.69 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  31.67 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1677  hypothetical protein  23.24 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.696772  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  26.15 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  27.87 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  24.49 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  32.82 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  25.9 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>