More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3248 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  99.39 
 
 
328 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  99.39 
 
 
328 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  76.23 
 
 
334 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  75.3 
 
 
332 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  56.59 
 
 
336 aa  371  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  57.58 
 
 
335 aa  363  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  56.42 
 
 
374 aa  352  4e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  52.88 
 
 
329 aa  315  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  48.8 
 
 
339 aa  314  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  46.39 
 
 
325 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  44.58 
 
 
315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  45.95 
 
 
345 aa  269  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  45.17 
 
 
314 aa  252  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  40.18 
 
 
329 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  40.74 
 
 
324 aa  248  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  43.79 
 
 
313 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  41.35 
 
 
316 aa  245  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  43.69 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  43.45 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  43.45 
 
 
314 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  43.54 
 
 
328 aa  241  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  42.96 
 
 
330 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  42.81 
 
 
311 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  42.61 
 
 
314 aa  238  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  42.41 
 
 
314 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  42.07 
 
 
314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  41.72 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  44.37 
 
 
328 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  39.52 
 
 
333 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  39.38 
 
 
328 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  38.91 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  38.31 
 
 
325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  36.84 
 
 
323 aa  205  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  34.28 
 
 
319 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  37.11 
 
 
322 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  40.15 
 
 
323 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  36.99 
 
 
319 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  38.57 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  35.27 
 
 
319 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  35.27 
 
 
319 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  35.27 
 
 
319 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  36.3 
 
 
319 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  37.79 
 
 
346 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  34.59 
 
 
319 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  35.96 
 
 
319 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  33.56 
 
 
335 aa  179  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  34.25 
 
 
319 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  35.71 
 
 
329 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  35.39 
 
 
326 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  32.43 
 
 
330 aa  176  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  34.98 
 
 
317 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  33.67 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  34.01 
 
 
325 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  32.66 
 
 
323 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  33.56 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  30.91 
 
 
332 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  33.89 
 
 
326 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  33 
 
 
326 aa  160  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  31.76 
 
 
328 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  33.79 
 
 
322 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  31.45 
 
 
334 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  32.53 
 
 
358 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  30.38 
 
 
332 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  32.76 
 
 
337 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  33.11 
 
 
321 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  31.91 
 
 
330 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.08 
 
 
342 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  31.54 
 
 
325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  31.34 
 
 
322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  30.43 
 
 
341 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  30.42 
 
 
336 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  29.97 
 
 
320 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  29.13 
 
 
321 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  31.85 
 
 
329 aa  142  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  30.42 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  31.89 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  30.99 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  30.99 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  32.88 
 
 
324 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  32.88 
 
 
324 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  31.06 
 
 
327 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  30.5 
 
 
319 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  28.04 
 
 
323 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  31.87 
 
 
324 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  28.21 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  29.54 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  27.97 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  29.33 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  29.34 
 
 
317 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  29.34 
 
 
317 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  29.34 
 
 
317 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  29.54 
 
 
317 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  29.54 
 
 
317 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  28.89 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  26.52 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  28.09 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  27.48 
 
 
322 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  27.42 
 
 
325 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>