More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2111 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  100 
 
 
162 aa  312  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  100 
 
 
162 aa  312  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  100 
 
 
162 aa  312  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  79.01 
 
 
162 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  53.8 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  54.97 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  50.68 
 
 
175 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  52.32 
 
 
203 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  50 
 
 
164 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  50 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  45.45 
 
 
433 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  47.68 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  46.1 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  43.59 
 
 
432 aa  107  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  45.39 
 
 
167 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  44.08 
 
 
182 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  43.79 
 
 
164 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  45.95 
 
 
168 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  49.65 
 
 
410 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  46.46 
 
 
427 aa  101  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  45.74 
 
 
414 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  41.5 
 
 
418 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  44.97 
 
 
170 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  61.4 
 
 
181 aa  97.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  40.67 
 
 
415 aa  97.4  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  40.69 
 
 
415 aa  97.4  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  37.79 
 
 
172 aa  97.1  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  47.88 
 
 
173 aa  97.1  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  40.94 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  42.55 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  46.1 
 
 
408 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  46.1 
 
 
408 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  41.43 
 
 
413 aa  97.1  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  37.13 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  45.71 
 
 
438 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  41.48 
 
 
416 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  50.91 
 
 
432 aa  95.5  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.03 
 
 
424 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  37.58 
 
 
160 aa  94.7  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  41.06 
 
 
181 aa  94.4  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  42.03 
 
 
415 aa  94.4  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  39.52 
 
 
423 aa  94  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  41.45 
 
 
218 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  45.39 
 
 
408 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  39.33 
 
 
415 aa  92.8  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  41.13 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  40.56 
 
 
417 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  41.61 
 
 
196 aa  90.9  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  39.86 
 
 
421 aa  91.3  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  39.58 
 
 
413 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  38.78 
 
 
429 aa  90.9  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  36.43 
 
 
411 aa  90.5  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.72 
 
 
433 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  39.46 
 
 
416 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  40.54 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  39.51 
 
 
419 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  44.76 
 
 
447 aa  90.1  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  37.91 
 
 
413 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  45.86 
 
 
408 aa  89.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  40.41 
 
 
437 aa  87.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  49.23 
 
 
157 aa  87.4  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  34.93 
 
 
408 aa  87  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  41.01 
 
 
436 aa  87  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  38.78 
 
 
416 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  42.86 
 
 
157 aa  87  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  45.83 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  38.61 
 
 
416 aa  87  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  35.37 
 
 
411 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  39.86 
 
 
420 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  32.14 
 
 
415 aa  86.3  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  39.24 
 
 
178 aa  85.9  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  38.85 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  36.5 
 
 
406 aa  85.1  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  38.03 
 
 
416 aa  85.1  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  37.58 
 
 
166 aa  85.1  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  40.58 
 
 
371 aa  85.1  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  36.43 
 
 
400 aa  84.7  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  42.41 
 
 
422 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  38.13 
 
 
412 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  37.41 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  37.41 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  40 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  41.27 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  41.22 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  33.1 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  33.11 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  42.5 
 
 
434 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  36.69 
 
 
412 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  39.49 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  37.41 
 
 
412 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  37.41 
 
 
412 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  42.36 
 
 
166 aa  82  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  37.41 
 
 
412 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  37.41 
 
 
412 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  43.1 
 
 
425 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  36.91 
 
 
166 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  37.5 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  38.55 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.1 
 
 
430 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  37.24 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>