More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1767 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1833  acyl-CoA synthetase  98.54 
 
 
549 aa  1089    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.936288  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2010  acyl-CoA synthetase  75.69 
 
 
550 aa  835    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1767  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
549 aa  1105    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.848326  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1786  acyl-CoA synthetase  98.54 
 
 
549 aa  1089    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4335  acyl-CoA synthetase  74.73 
 
 
550 aa  823    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0901424  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2935  acyl-CoA synthetase  56.7 
 
 
558 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444954  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2891  acyl-CoA synthetase  56.7 
 
 
558 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2921  acyl-CoA synthetase  56.7 
 
 
558 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0691  AMP-dependent synthetase and ligase  45.71 
 
 
553 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5009  acyl-CoA synthetase  40.8 
 
 
549 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138056  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4715  acyl-CoA synthetase  40.33 
 
 
549 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4627  acyl-CoA synthetase  40.33 
 
 
549 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1485  CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  43.82 
 
 
528 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13548  acyl-CoA synthetase  40.18 
 
 
548 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.89294e-46  hitchhiker  0.000000367112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3959  AMP-dependent synthetase and ligase  39.49 
 
 
547 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5215  acyl-CoA synthetase  39.75 
 
 
549 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1543  acyl-CoA synthetase  39.05 
 
 
549 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3496  AMP-dependent synthetase and ligase  40.29 
 
 
544 aa  359  7e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2836  acyl-CoA synthetase  41.01 
 
 
539 aa  355  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4748  AMP-dependent synthetase and ligase  40.92 
 
 
528 aa  352  7e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4349  acyl-CoA synthetase  40.26 
 
 
541 aa  348  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1756  acyl-CoA synthetase  39.34 
 
 
542 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317816  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1822  acyl-CoA synthetase  39.34 
 
 
542 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591345  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1775  acyl-CoA synthetase  39.34 
 
 
542 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1995  acyl-CoA synthetase  38.36 
 
 
541 aa  344  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2174  acyl-CoA synthetase  40.07 
 
 
540 aa  344  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264892  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3980  AMP-dependent synthetase and ligase  39.23 
 
 
526 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2639  acyl-CoA synthetase  39.81 
 
 
540 aa  329  9e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.981359  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  40.65 
 
 
557 aa  320  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597937  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2248  acyl-CoA synthetase  39.81 
 
 
550 aa  320  6e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2725  acyl-CoA synthetase  39.1 
 
 
548 aa  317  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0888  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 
545 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2206  acyl-CoA synthetase  36 
 
 
536 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0886048  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 
545 aa  303  6.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.172383  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5298  acyl-CoA synthetase  34.49 
 
 
536 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1759  acyl-CoA synthetase  34.92 
 
 
536 aa  290  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1563  acyl-CoA synthetase  36.87 
 
 
531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1531  acyl-CoA synthetase  35.27 
 
 
531 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0290  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
605 aa  249  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000671199  hitchhiker  0.000133038 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 
509 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  25.47 
 
 
608 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.47643  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13546  fatty-acid-CoA ligase fadD18  51.33 
 
 
218 aa  154  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.46199e-133  hitchhiker  0.000000428617 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 
517 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1806  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 
526 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 
515 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 
515 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 
526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 
515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 
519 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  26.67 
 
 
560 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 
516 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
520 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 
523 aa  143  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.09 
 
 
525 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 
527 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 
518 aa  143  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  29.42 
 
 
504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.86 
 
 
525 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 
510 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 
517 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 
517 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 
524 aa  140  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 
577 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 
528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 
517 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 
546 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 
520 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 
553 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 
518 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.87 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 
516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  24.78 
 
 
549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 
862 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  24.61 
 
 
549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.74 
 
 
497 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.74 
 
 
497 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.84 
 
 
526 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 
518 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0797  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.71 
 
 
568 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.058688  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  29.51 
 
 
487 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 
539 aa  134  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.73 
 
 
525 aa  134  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0119  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 
506 aa  134  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.976048  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 
551 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 
565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.28 
 
 
525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 
515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  25.26 
 
 
552 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 
520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0330  AMP-dependent synthetase and ligase  25.18 
 
 
559 aa  131  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  26.25 
 
 
577 aa  131  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.8 
 
 
499 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  25.73 
 
 
552 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  28.07 
 
 
565 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0727  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.99 
 
 
568 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.538259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  27.45 
 
 
534 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 
5154 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>