296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0356 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  100 
 
 
103 aa  207  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  80.72 
 
 
105 aa  142  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  70.73 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1256  RNP-1 like RNA-binding protein  67.47 
 
 
86 aa  104  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.737942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1566  RNA recognition motif-containing protein  52.69 
 
 
184 aa  100  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.306612  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  52.38 
 
 
123 aa  88.6  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  50 
 
 
176 aa  88.6  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
175 aa  88.2  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  51.19 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  48.81 
 
 
176 aa  86.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
181 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  48.28 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  47.62 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  48.28 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  48.81 
 
 
149 aa  84.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  51.19 
 
 
124 aa  84.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  48.81 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  48.81 
 
 
121 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  48.81 
 
 
151 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  48.81 
 
 
121 aa  84  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  48.75 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  46.43 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  47.62 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  50.62 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  44.21 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  47.62 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  50.65 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  46.43 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  48.75 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  50 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  45.24 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  45.24 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  49.33 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  48.15 
 
 
89 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  48.28 
 
 
87 aa  80.1  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  46.43 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  46.32 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  45.68 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  45.78 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  44.19 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  43.62 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  48.84 
 
 
88 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  46.91 
 
 
85 aa  77  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  47.62 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  45.56 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  44.44 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  45.33 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  46.43 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  49.35 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  39.77 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  41.94 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  46.34 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  46.75 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  44.71 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  41.67 
 
 
241 aa  73.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  48.72 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  45.24 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  45.65 
 
 
114 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  48.1 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  37.25 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  45.57 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  45.24 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  46.58 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  45.88 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  39.36 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  41.98 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  45.24 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  40.96 
 
 
87 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  40.45 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  44.44 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  39.81 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  41.25 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  43.06 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  38.75 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  39.58 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  43.04 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  38.78 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  42.17 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0508  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.77 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  44.3 
 
 
83 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  47.5 
 
 
207 aa  67  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  39.33 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  47.37 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0482  HIT family protein  50.79 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.417177  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  45.45 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  43.06 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  39.24 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  43.59 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  43.68 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  37.8 
 
 
82 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  38.27 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  43.42 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  36.17 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  46.05 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  36.17 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>