More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5487 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5487  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643829  normal  0.289527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  47.04 
 
 
461 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  45.49 
 
 
356 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  45.14 
 
 
356 aa  185  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  43.9 
 
 
442 aa  185  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  40.29 
 
 
405 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12993  transposase  44.6 
 
 
459 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000929698  normal  0.662784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  43.82 
 
 
442 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  43.82 
 
 
442 aa  175  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12899  transposase  44.07 
 
 
460 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0267522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12804  transposase  42.81 
 
 
459 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00653678  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  37.36 
 
 
363 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  45.3 
 
 
261 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  32.86 
 
 
393 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  32.86 
 
 
393 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  34.67 
 
 
409 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2321  transposase, IS605 OrfB family  31.32 
 
 
374 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  53.38 
 
 
249 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  28.62 
 
 
403 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  34.41 
 
 
399 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  34.41 
 
 
399 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13861  transposase  42.56 
 
 
407 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  36.17 
 
 
399 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  37.59 
 
 
383 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  34.41 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  55.83 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.93 
 
 
391 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  46.67 
 
 
420 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  33.56 
 
 
393 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  34.81 
 
 
440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  29.14 
 
 
394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  33.22 
 
 
398 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  33.99 
 
 
392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  37.25 
 
 
410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  33.33 
 
 
450 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  36.44 
 
 
405 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  33.22 
 
 
398 aa  126  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  33.91 
 
 
292 aa  126  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  32.99 
 
 
390 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  33.22 
 
 
398 aa  126  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  32.99 
 
 
427 aa  125  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  27.7 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  33.68 
 
 
392 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  26.97 
 
 
373 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  28.09 
 
 
372 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  28.16 
 
 
370 aa  122  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  27.72 
 
 
373 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  28.88 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  35.12 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  34.73 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  36.67 
 
 
424 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  28.46 
 
 
372 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  28.22 
 
 
369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  28.88 
 
 
393 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  28.22 
 
 
369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  31.94 
 
 
392 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  28.22 
 
 
369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  28.22 
 
 
369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  28.22 
 
 
369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2297  transposase IS605 OrfB  57.84 
 
 
192 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294637  normal  0.708384 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  27.72 
 
 
372 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  29.24 
 
 
370 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  27.72 
 
 
372 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  26.59 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  26.59 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  26.59 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  27.66 
 
 
370 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  27.44 
 
 
370 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0093  family transposase, OrfB  32.69 
 
 
372 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0120  family transposase, OrfB  32.69 
 
 
372 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000180959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.3 
 
 
376 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  27.3 
 
 
372 aa  118  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  26.07 
 
 
370 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  27.44 
 
 
370 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  29.68 
 
 
384 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0067  IS605 family transposase OrfB  29.43 
 
 
370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0099  transposase, OrfB family  29.43 
 
 
370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414813  hitchhiker  0.000000000012514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  27.08 
 
 
370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  27.27 
 
 
370 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  25.87 
 
 
326 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.47 
 
 
381 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  29.33 
 
 
384 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  25.54 
 
 
311 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  27.44 
 
 
393 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  32.08 
 
 
393 aa  116  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  29.17 
 
 
382 aa  116  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.64 
 
 
381 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  29.68 
 
 
384 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  29.18 
 
 
384 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  29.18 
 
 
383 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  27.34 
 
 
373 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0272  transposase  29.43 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  29.75 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  28.79 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  26.84 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  33.21 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  28.01 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  29.18 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  29.18 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  29.18 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>