73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0137 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
185 aa  366  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  41.53 
 
 
190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  31.72 
 
 
184 aa  88.2  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  37.14 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.14 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  37.14 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  33.93 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  32.64 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  33.82 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  30.19 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  32.37 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  29.81 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  28.81 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  28.81 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  32.21 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  32.89 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  28.25 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  31.06 
 
 
200 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  30.29 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  32.59 
 
 
193 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  27.16 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  30.63 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  28.14 
 
 
188 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  33.11 
 
 
194 aa  54.3  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  28.72 
 
 
217 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  32.14 
 
 
229 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  27.88 
 
 
189 aa  51.6  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  31.14 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  26.03 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  26 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.17 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  26.49 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  28.15 
 
 
186 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  27.22 
 
 
190 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  27.22 
 
 
190 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  27.22 
 
 
190 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  26.9 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  25 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  25.56 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 
187 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  30.58 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  27.34 
 
 
185 aa  44.7  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  29.1 
 
 
195 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.66 
 
 
180 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  28.28 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.56 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  28.28 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  27.54 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  28.67 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  25.87 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.54 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  27.54 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  27.54 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  27.54 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  27.54 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  27.54 
 
 
187 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.23 
 
 
180 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 
184 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  26.09 
 
 
185 aa  41.2  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  27.59 
 
 
184 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>