More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3437 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 305 aa  598  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3746  glutamine amidotransferase class-I  99.3 
 
 		 286 aa  557  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3633  glutamine amidotransferase class-I  88.46 
 
 		 293 aa  488  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125092  normal  0.0172183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5032  glutamine amidotransferase class-I  62.82 
 
 		 282 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6777  glutamine amidotransferase class-I  57.65 
 
 		 284 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  44.84 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0165  glutamine amidotransferase class-I  46.07 
 
 		 286 aa  232  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  45.09 
 
 		 276 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  41.88 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  33.97 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  32.04 
 
 		 244 aa  86.3  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  34.29 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  35.44 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  32.56 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  36.67 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  39.86 
 
 		 236 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  32.56 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  36.23 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  36.69 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  35.51 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  34.01 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  36 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  30.57 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  30.19 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  33.09 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  32.32 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  33.53 
 
 		 519 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  34.22 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  32.95 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  33.68 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  36.09 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  31.96 
 
 		 233 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  27.46 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  33.58 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.64 
 
 		 536 aa  63.5  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  27.97 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  36.88 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  34.72 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  33.55 
 
 		 535 aa  62.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  32.59 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  33.11 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  38.46 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  33.52 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  34.34 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  30 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1733  GMP synthase, large subunit  37.6 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.699904  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  30.07 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.81 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  34.42 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  30.82 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  24.12 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  30.67 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  33.77 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  32.69 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  32.21 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  29.68 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  33.33 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  36.64 
 
 		 533 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  32.12 
 
 		 520 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  35.46 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  37.04 
 
 		 523 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  41.07 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  30.26 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.79 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  34.29 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  34.29 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  29.68 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  29.05 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  32.93 
 
 		 520 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  29.21 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  30.68 
 
 		 506 aa  55.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  33.33 
 
 		 513 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  34.48 
 
 		 525 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  34.48 
 
 		 525 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  31.52 
 
 		 520 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  34.48 
 
 		 525 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  28.09 
 
 		 510 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1173  GMP synthase  37.78 
 
 		 519 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868415  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  32.59 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  33.09 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  34.48 
 
 		 525 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  29.22 
 
 		 513 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.64 
 
 		 533 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1190  GMP synthase  37.78 
 
 		 519 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1516  GMP synthase  37.04 
 
 		 522 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1200  GMP synthase  37.78 
 
 		 519 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  32.24 
 
 		 224 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  29.59 
 
 		 252 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  26.03 
 
 		 189 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  30.49 
 
 		 520 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  31.9 
 
 		 526 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  34.29 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  34.48 
 
 		 525 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  30.25 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  41.44 
 
 		 527 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  30.72 
 
 		 527 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  39.45 
 
 		 508 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4903  GMP synthase  37.04 
 
 		 522 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.137023  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  38.89 
 
 		 517 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>