55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1008 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  430  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  93.24 
 
 		 222 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  54.59 
 
 		 229 aa  213  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  50.95 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  46.7 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  44.39 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  45.97 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  44.86 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  48.82 
 
 		 211 aa  177  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  47.62 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  46.15 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  37.09 
 
 		 255 aa  167  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  43.75 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  31.46 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  32.72 
 
 		 393 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  30.99 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  35.94 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  27.83 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  27.91 
 
 		 254 aa  95.9  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  28.37 
 
 		 254 aa  95.9  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  32.72 
 
 		 220 aa  95.1  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  26.43 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  28.83 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  28.63 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  32.55 
 
 		 393 aa  85.9  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  31.6 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  40.12 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  28.89 
 
 		 325 aa  79  0.00000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  28.7 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  28.31 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  26.29 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  33.04 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  34.72 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  22.22 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  29.65 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  33.96 
 
 		 338 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  31.62 
 
 		 313 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  28.83 
 
 		 382 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  33.02 
 
 		 338 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3739  PGAP1 family protein  30.09 
 
 		 415 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  32.82 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  26.42 
 
 		 294 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  31.67 
 
 		 324 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0985  hypothetical protein  24.82 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0380637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  29.31 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  27.67 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  31.78 
 
 		 958 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  32.8 
 
 		 309 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 340 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 343 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  33.04 
 
 		 339 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  38.03 
 
 		 364 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  30.83 
 
 		 282 aa  42  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 340 aa  42  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 288 aa  41.6  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>