More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0441 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0441  putative insertion element protein  100 
 
 		 111 aa  229  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  97.3 
 
 		 250 aa  221  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  96.36 
 
 		 278 aa  216  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  95.5 
 
 		 278 aa  215  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  91.82 
 
 		 278 aa  208  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  85.45 
 
 		 250 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  90.18 
 
 		 251 aa  193  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  74.31 
 
 		 276 aa  173  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  75.76 
 
 		 240 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  75.76 
 
 		 240 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  75.76 
 
 		 240 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  66.06 
 
 		 286 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  62.96 
 
 		 284 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  65.14 
 
 		 282 aa  148  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  66.99 
 
 		 283 aa  147  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  60.19 
 
 		 267 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  60.19 
 
 		 271 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  60.19 
 
 		 267 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  61.47 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  61.47 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  64.58 
 
 		 231 aa  138  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  64.58 
 
 		 231 aa  138  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  64.58 
 
 		 231 aa  138  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  64.58 
 
 		 231 aa  138  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  58.72 
 
 		 265 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  60.19 
 
 		 289 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  60.19 
 
 		 289 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  60.19 
 
 		 289 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  60.19 
 
 		 289 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  60.19 
 
 		 289 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  58.26 
 
 		 309 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8384  hypothetical protein  83.33 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1009  transposase  53.4 
 
 		 225 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  61.04 
 
 		 209 aa  110  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  61.04 
 
 		 209 aa  110  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0120  hypothetical protein  54.32 
 
 		 205 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0800  IstB ATP binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  42.2 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  34.55 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  34.55 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  34.55 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  34.55 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  34.55 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  34.55 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  33.94 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  78.79 
 
 		 174 aa  63.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  78.79 
 
 		 174 aa  63.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3275  transposase orfB  51.72 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4236  integrase catalytic region  37.25 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179979  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  40.43 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1442  putative transposase  34.07 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  40.43 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1570  putative transposase  34.07 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2055  putative transposase  34.07 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0591604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  40.43 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3249  transposase orfB  50 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  40.43 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  40.43 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4858  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 282 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 345 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 345 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 345 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 345 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3307  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 272 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1112  integrase, catalytic region  41.1 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.329084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  40.57 
 
 		 260 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  40.57 
 
 		 260 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 345 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 345 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 345 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 345 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0958  integrase catalytic region  34.55 
 
 		 263 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 358 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  38.32 
 
 		 279 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  38.32 
 
 		 279 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  34.62 
 
 		 272 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2010  putative transposase  34.07 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  34.62 
 
 		 272 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  34.62 
 
 		 272 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  34.62 
 
 		 272 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  34.62 
 
 		 272 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00732  transposase  35.42 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  36.54 
 
 		 307 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  38.32 
 
 		 279 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  38.32 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  38.32 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  29.25 
 
 		 282 aa  60.1  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  29.25 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  35.4 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  37.04 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>