More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1570 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1442  putative transposase  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1570  putative transposase  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2055  putative transposase  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0591604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2010  putative transposase  98.35 
 
 
182 aa  367  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4236  integrase catalytic region  68.6 
 
 
282 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179979  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4858  integrase catalytic subunit  68.02 
 
 
282 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3307  integrase catalytic subunit  67.28 
 
 
272 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0133  transposase B  51.88 
 
 
269 aa  160  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0094  integrase core subunit  51.88 
 
 
269 aa  159  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.445692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1695  putative transposase  98.7 
 
 
77 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  43.45 
 
 
279 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  43.45 
 
 
279 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  43.45 
 
 
279 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  43.45 
 
 
279 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  43.45 
 
 
279 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  45.29 
 
 
305 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  45.29 
 
 
305 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7700  IS3 family transposase  43.2 
 
 
359 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  54.93 
 
 
251 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0067  integrase catalytic region  54.93 
 
 
251 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  49.02 
 
 
280 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  47.68 
 
 
272 aa  144  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  47.68 
 
 
272 aa  144  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  47.68 
 
 
272 aa  144  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  47.68 
 
 
272 aa  144  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  47.68 
 
 
272 aa  144  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  47.37 
 
 
260 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  47.37 
 
 
260 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3126  integrase catalytic subunit  44.08 
 
 
265 aa  137  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3247  integrase catalytic subunit  44.08 
 
 
265 aa  137  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00558432  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3535  integrase catalytic subunit  44.08 
 
 
265 aa  137  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323423  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2970  integrase catalytic subunit  44.08 
 
 
265 aa  137  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0996434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1494  hypothetical protein  45.39 
 
 
230 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0958  integrase catalytic region  40.35 
 
 
263 aa  134  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  40.7 
 
 
307 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  38.6 
 
 
372 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  38.6 
 
 
372 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  38.6 
 
 
372 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  38.6 
 
 
372 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  40.83 
 
 
309 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  38.6 
 
 
372 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  38.6 
 
 
372 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  38.6 
 
 
372 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  38.6 
 
 
372 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  38.6 
 
 
372 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  38.6 
 
 
372 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1439  ISRSO12-transposase ORFB protein  54.31 
 
 
234 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2706  ISRSO12-transposase ORFB protein  54.31 
 
 
234 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.147887 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0504  ISRSO12-transposase ORFB protein  54.31 
 
 
234 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  38.37 
 
 
312 aa  128  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  39.53 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  39.53 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1432  Integrase catalytic region  48 
 
 
269 aa  124  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  43.14 
 
 
276 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  38.24 
 
 
309 aa  121  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  38.24 
 
 
309 aa  121  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  38.24 
 
 
309 aa  121  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  37.79 
 
 
284 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7753  putative transposase  45.93 
 
 
192 aa  121  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.0854702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  40.37 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  42.48 
 
 
290 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  42.48 
 
 
290 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  40.37 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  40.37 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  40.37 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  40.37 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  42.86 
 
 
274 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  42.21 
 
 
277 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  41.22 
 
 
269 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0298  IS407A, transposase OrfB  42.21 
 
 
277 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000127276  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3877  A, transposase OrfB  42.21 
 
 
277 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  41.06 
 
 
237 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  41.06 
 
 
237 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  41.06 
 
 
237 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  41.06 
 
 
237 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  42 
 
 
276 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  42 
 
 
276 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  42 
 
 
276 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1523  A, transposase OrfB  40.65 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2513  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.026452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1075  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536905  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1250  IS407A, transposase OrfB  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119711  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1472  IS1404 transposase  41.56 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>