More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00732 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00732  transposase  100 
 
 
174 aa  353  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  93.66 
 
 
281 aa  266  8e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  93.66 
 
 
281 aa  265  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01934  ISXoo3 transposase ORF A  92.25 
 
 
257 aa  263  8e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02391  ISXoo3 transposase ORF B  92.96 
 
 
281 aa  263  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.555401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  92.25 
 
 
281 aa  263  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02652  ISXoo3 transposase ORF B  92.25 
 
 
281 aa  261  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01958  transposase  90.85 
 
 
241 aa  258  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.064583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03997  ISXoo3 transposase ORF B  91.55 
 
 
281 aa  258  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  89.44 
 
 
281 aa  253  7e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02941  ISXoo3 transposase ORF B  90.14 
 
 
281 aa  253  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06055  integrase core domain protein  90.14 
 
 
281 aa  253  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  90.14 
 
 
281 aa  253  9e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06246  ISXoo3 transposase ORF B  92.25 
 
 
281 aa  239  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01072  ISXoo3 transposase ORF B  92.25 
 
 
281 aa  239  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00239  transposase  83.8 
 
 
175 aa  229  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04077  transposase  91.53 
 
 
165 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03026  transposase  88.98 
 
 
118 aa  204  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02529  transposase  95.96 
 
 
99 aa  185  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00700  transposase  95.96 
 
 
99 aa  184  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.782248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1302  putative transposase  74.4 
 
 
173 aa  184  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02556  transposase  94.95 
 
 
99 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01971  transposase  94.79 
 
 
97 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0526075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03280  transposase  95.7 
 
 
102 aa  175  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.495134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03797  transposase  95.7 
 
 
149 aa  174  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02482  transposase  88.89 
 
 
99 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02571  transposase  91.18 
 
 
137 aa  154  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  44.2 
 
 
279 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  44.6 
 
 
280 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  46.34 
 
 
309 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  46.34 
 
 
309 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  46.34 
 
 
309 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  39.69 
 
 
274 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  40.94 
 
 
312 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01378  transposase  85.71 
 
 
64 aa  99.8  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0376  integrase catalytic region  46.56 
 
 
274 aa  99  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000146675  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  42.28 
 
 
290 aa  98.2  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  42.28 
 
 
290 aa  98.2  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  38.36 
 
 
284 aa  97.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  42.28 
 
 
290 aa  97.4  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  42.28 
 
 
290 aa  97.4  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  40.65 
 
 
307 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  40.16 
 
 
277 aa  94.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0869  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00570165  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1005  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2073  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0312  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0097322  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1719  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0006  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126807  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0043  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0125  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128078  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0464  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0491  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0684  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0782  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0964  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.466029  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1243  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1265  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.399396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1345  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1457  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1524  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0152  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1522  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3069  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3103  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3133  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3298  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3409  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3477  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3523  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0008  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0023  IS1404 transposase  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0026  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0068  IS1404 transposase  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0183  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0263  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0587266  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0301  IS1404 transposase  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0406  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0471  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>