More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03026 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03026  transposase  100 
 
 		 118 aa  235  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  99.15 
 
 		 281 aa  234  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01958  transposase  96.61 
 
 		 241 aa  228  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.064583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04077  transposase  97.46 
 
 		 165 aa  228  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02941  ISXoo3 transposase ORF B  97.46 
 
 		 281 aa  228  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06055  integrase core domain protein  97.46 
 
 		 281 aa  228  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  94.92 
 
 		 281 aa  223  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01934  ISXoo3 transposase ORF A  94.07 
 
 		 257 aa  221  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03997  ISXoo3 transposase ORF B  94.92 
 
 		 281 aa  220  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  94.07 
 
 		 281 aa  219  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  94.07 
 
 		 281 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02652  ISXoo3 transposase ORF B  93.22 
 
 		 281 aa  217  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  92.37 
 
 		 281 aa  215  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02391  ISXoo3 transposase ORF B  91.53 
 
 		 281 aa  210  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.555401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00732  transposase  88.98 
 
 		 174 aa  204  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06246  ISXoo3 transposase ORF B  93.22 
 
 		 281 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01072  ISXoo3 transposase ORF B  93.22 
 
 		 281 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02482  transposase  97.98 
 
 		 99 aa  191  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02529  transposase  94.95 
 
 		 99 aa  185  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02556  transposase  93.94 
 
 		 99 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01971  transposase  94.85 
 
 		 97 aa  181  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0526075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00700  transposase  92.93 
 
 		 99 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.782248  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00239  transposase  81.36 
 
 		 175 aa  174  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03280  transposase  92.47 
 
 		 102 aa  170  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.495134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03797  transposase  92.47 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02571  transposase  82.91 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1302  putative transposase  71.29 
 
 		 173 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01378  transposase  82.54 
 
 		 64 aa  93.6  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  47.42 
 
 		 309 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  47.42 
 
 		 309 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  47.42 
 
 		 309 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  38.61 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  38.61 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  39.32 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  38.61 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  42.27 
 
 		 290 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  42.27 
 
 		 290 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  42.27 
 
 		 290 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  42.27 
 
 		 290 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  42.27 
 
 		 312 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4649  IS1477 transposase  43.75 
 
 		 203 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.220345  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  41.24 
 
 		 307 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  37.37 
 
 		 274 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  40.21 
 
 		 309 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2602  integrase catalytic subunit  37.62 
 
 		 282 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.323138 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  37.11 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1971  hypothetical protein  37.25 
 
 		 270 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0965  ISSod2, transposase OrfB  38.61 
 
 		 271 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2160  ISSod2, transposase OrfB  38.61 
 
 		 271 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4269  ISSod2, transposase OrfB  38.61 
 
 		 271 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  42.16 
 
 		 280 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  41.58 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0376  integrase catalytic region  43.14 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000146675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0806  hypothetical protein  37.11 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0787  hypothetical protein  37.11 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  41.24 
 
 		 290 aa  58.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3393  integrase catalytic subunit  37.11 
 
 		 274 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  38.38 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  38.38 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0618  ISxcd1 transposase  33.98 
 
 		 266 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3364  ISxcd1 transposase  33.98 
 
 		 266 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  38.38 
 
 		 269 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  38.38 
 
 		 269 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  38.38 
 
 		 269 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1079  hypothetical protein  36.27 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  37.11 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4320  integrase catalytic subunit  32.99 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  34.19 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  34.19 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  33.68 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  33.68 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  33.68 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  33.68 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  33.68 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  33.68 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4215  ISxcd1 transposase  35.92 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0800  hypothetical protein  36.27 
 
 		 281 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  39.18 
 
 		 306 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3442  integrase catalytic subunit  35.92 
 
 		 266 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  35.35 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00714  transposase  92.59 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00306145  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  35.35 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  35.35 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  35.35 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  35.35 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  41.41 
 
 		 260 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  41.41 
 
 		 260 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  36.17 
 
 		 237 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  36.17 
 
 		 237 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  36.17 
 
 		 237 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  36.17 
 
 		 237 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  39 
 
 		 277 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2092  IS1404 transposase  39 
 
 		 277 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.702251  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1077  IS407A, transposase OrfB  39 
 
 		 277 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2087  IS407A, transposase OrfB  39 
 
 		 277 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.879853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0298  IS407A, transposase OrfB  39 
 
 		 277 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000127276  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0751  A, transposase OrfB  39 
 
 		 277 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0578  IS407A, transposase OrfB  39 
 
 		 277 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00042542  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0283  IS407A, transposase OrfB  39 
 
 		 277 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.010372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0916  IS1404 transposase  39 
 
 		 277 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.08835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>