More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01934 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01934  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 
257 aa  524  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  97.32 
 
 
281 aa  292  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  97.32 
 
 
281 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02652  ISXoo3 transposase ORF B  96.64 
 
 
281 aa  288  7e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02391  ISXoo3 transposase ORF B  96.64 
 
 
281 aa  286  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.555401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  95.97 
 
 
281 aa  286  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03997  ISXoo3 transposase ORF B  95.97 
 
 
281 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  95.97 
 
 
281 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06055  integrase core domain protein  94.63 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01958  transposase  94.63 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.064583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02941  ISXoo3 transposase ORF B  94.63 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  95.97 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00732  transposase  92.25 
 
 
174 aa  263  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06246  ISXoo3 transposase ORF B  92.62 
 
 
281 aa  256  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01072  ISXoo3 transposase ORF B  92.62 
 
 
281 aa  256  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04077  transposase  94.26 
 
 
165 aa  228  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00239  transposase  80.41 
 
 
175 aa  228  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03026  transposase  94.07 
 
 
118 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02556  transposase  98.99 
 
 
99 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100793  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1302  putative transposase  73.48 
 
 
173 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02529  transposase  97.98 
 
 
99 aa  192  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01971  transposase  97.94 
 
 
97 aa  189  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0526075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00700  transposase  95.96 
 
 
99 aa  186  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.782248  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03797  transposase  94.85 
 
 
149 aa  181  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02482  transposase  92.93 
 
 
99 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03280  transposase  96.77 
 
 
102 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.495134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02571  transposase  82.05 
 
 
137 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  42.11 
 
 
393 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  39.23 
 
 
372 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  39.23 
 
 
372 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  39.23 
 
 
372 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  39.23 
 
 
372 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  39.23 
 
 
372 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  39.23 
 
 
372 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  39.23 
 
 
372 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  39.23 
 
 
372 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  39.23 
 
 
372 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  39.23 
 
 
372 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  34.86 
 
 
370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  34.86 
 
 
370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  34.86 
 
 
370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  34.86 
 
 
370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  34.86 
 
 
370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  34.86 
 
 
370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  34.86 
 
 
370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2460  transposase IS3/IS911 family protein  38.5 
 
 
298 aa  125  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  36.41 
 
 
362 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  36.41 
 
 
362 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  36.41 
 
 
362 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01538  ISXoo3 transposase ORF A  89.06 
 
 
87 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.297821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02483  ISXoo3 transposase ORF A  89.06 
 
 
87 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02393  ISXoo3 transposase ORF A  89.06 
 
 
87 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.567997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04016  ISXoo3 transposase ORF A  89.06 
 
 
87 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04438  ISXoo3 transposase ORF A  89.06 
 
 
89 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00713  transposase  89.06 
 
 
87 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02901  ISXoo3 transposase ORF A  89.06 
 
 
87 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02528  ISXoo3 transposase ORF A  89.06 
 
 
87 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03998  ISXoo3 transposase ORF A  89.06 
 
 
87 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04490  ISXoo3 transposase ORF A  89.06 
 
 
87 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04193  ISXoo3 transposase ORF A  89.06 
 
 
87 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06245  ISXoo3 transposase ORF A  89.06 
 
 
87 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.311996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00699  ISXoo3 transposase ORF A  89.06 
 
 
87 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01074  ISXoo3 transposase ORF A  89.06 
 
 
87 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01959  ISXoo3 transposase ORF A  89.06 
 
 
87 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0236899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05777  IS66 family element, Orf1 protein, putative  89.06 
 
 
130 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05698  IS66 family element, Orf1 protein  89.06 
 
 
67 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0455822  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05448  IS66 family element, Orf1 protein, putative  89.06 
 
 
132 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05705  IS66 family element, Orf1 protein, putative  89.06 
 
 
132 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02572  ISXoo3 transposase ORF A  96.55 
 
 
87 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03602  ISXoo3 transposase ORF A  87.5 
 
 
87 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03025  ISXoo3 transposase ORF A  87.5 
 
 
87 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.752388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04312  transposase  87.5 
 
 
94 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02555  ISXoo3 transposase ORF A  87.5 
 
 
87 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.104602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02942  ISXoo3 transposase ORF A  87.5 
 
 
87 aa  116  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0664687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03197  ISXoo3 transposase ORF A  87.5 
 
 
87 aa  116  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.818728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01543  ISXoo3 transposase ORF A  87.5 
 
 
87 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03931  ISXoo3 transposase ORF A  87.5 
 
 
87 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02742  ISXoo3 transposase ORF A  85.94 
 
 
87 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03279  ISXoo3 transposase ORF A  85.94 
 
 
87 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01847  ISXoo3 transposase ORF A  93.1 
 
 
87 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  46.15 
 
 
309 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  46.15 
 
 
309 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  46.15 
 
 
309 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00733  ISXoo3 transposase ORF A  91.38 
 
 
87 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.632104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  47.37 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  46.21 
 
 
279 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  40.79 
 
 
284 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  43.85 
 
 
290 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  43.85 
 
 
290 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  43.85 
 
 
290 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  43.85 
 
 
290 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  43.31 
 
 
312 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4649  IS1477 transposase  42.96 
 
 
203 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.220345  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00281  transposase  97.96 
 
 
181 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  33.82 
 
 
362 aa  102  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  33.82 
 
 
362 aa  102  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  41.67 
 
 
274 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  38.93 
 
 
309 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0376  integrase catalytic region  47.48 
 
 
274 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000146675  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  38.93 
 
 
307 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>