183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0299 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0299  permease  100 
 
 		 286 aa  545  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  50.55 
 
 		 302 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  25.51 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  23.36 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  20.79 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23.36 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  21.94 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  21.31 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  21.9 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  21.66 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  20.63 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  21.52 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  21.79 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  26.61 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  19.14 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  21.08 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  21.71 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  23.85 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  22.91 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  25.35 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  25.1 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  23.96 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  23.47 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  19.68 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  22.32 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  29.05 
 
 		 475 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  20.63 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  20.69 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  19.17 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  20.69 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  19.73 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  22.95 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  23.32 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  22.73 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  21.08 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  23.57 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  21.55 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  21.56 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  17.7 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  19.84 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  29.6 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  21.43 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  20.8 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  20.16 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  22.97 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  21.08 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  20.96 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  22.5 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  20.31 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  22.97 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  21.83 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  24.73 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  27.91 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  23.65 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  21.83 
 
 		 363 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  27.27 
 
 		 433 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  20.51 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  21.62 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  21.55 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  19.77 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  22.98 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  21.68 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  21.37 
 
 		 353 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  25.66 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  25 
 
 		 461 aa  55.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  17.45 
 
 		 381 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  28.47 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  28.47 
 
 		 389 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  19.92 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  22.94 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  26.45 
 
 		 402 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  24.31 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  32.35 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  19.69 
 
 		 324 aa  53.1  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  26.19 
 
 		 474 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  21.28 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  19.15 
 
 		 330 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  24.6 
 
 		 423 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  20.96 
 
 		 331 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  22.42 
 
 		 338 aa  52.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  23.26 
 
 		 318 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  21.3 
 
 		 317 aa  52.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  18.46 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  20.52 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  20.08 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  22.77 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  24.83 
 
 		 390 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  27.33 
 
 		 433 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  17.48 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  18.39 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  17.67 
 
 		 367 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  20.38 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  22.37 
 
 		 490 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  22.31 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  20.59 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  23.38 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  18.53 
 
 		 354 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  25.2 
 
 		 330 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  20.59 
 
 		 331 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  17.74 
 
 		 346 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>