157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3079 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.2 
 
 		 295 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  64.71 
 
 		 296 aa  363  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.58 
 
 		 296 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  65.19 
 
 		 294 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  58.76 
 
 		 294 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  56.03 
 
 		 284 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  55.09 
 
 		 290 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  54.06 
 
 		 288 aa  280  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.1 
 
 		 294 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  58.03 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  59.77 
 
 		 290 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  56.99 
 
 		 290 aa  278  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  55.48 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.24 
 
 		 288 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  54.45 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  57.89 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  49.65 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  49.15 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  55.07 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  41.84 
 
 		 307 aa  178  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  41.84 
 
 		 307 aa  178  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  41.53 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  39.3 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.99 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  37.59 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  37.55 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  38.71 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  33.64 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.02 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  30.67 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3219  hypothetical protein  44.19 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  27.87 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.3 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  27.19 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  26.85 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.59 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  26.77 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  25.95 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  27.21 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  25.58 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  26.71 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  27.65 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  26.15 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  30.04 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  31.32 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.49 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1390  hypothetical protein  28 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  23.75 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.91 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  23.85 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5633  hypothetical protein  26.36 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  23.85 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  23.85 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3485  hypothetical protein  28.19 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000551734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  26.05 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  28.19 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  24.83 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  26.67 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.17 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  26.04 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  26.57 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  26.44 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  26.04 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1026  hypothetical protein  27.85 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.715879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  32.85 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  25.66 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  23.47 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3483  hypothetical protein  25.75 
 
 		 314 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  0.164721 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  23.47 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4555  hypothetical protein  25.75 
 
 		 314 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  25.83 
 
 		 307 aa  52.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  23.47 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  31.47 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  29.45 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  32.93 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  25.61 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  26.32 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  24.42 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5820  hypothetical protein  24.62 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  29.57 
 
 		 319 aa  49.7  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2070  hypothetical protein  28.14 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  31.62 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  28 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  31.76 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1370  hypothetical protein  23.18 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  0.119538 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  25.26 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.16 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0315  hypothetical protein  22.94 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  24.74 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  22.75 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  31.76 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  31.76 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.71 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>