More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2939 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2939  acetolactate synthase catalytic subunit  100 
 
 
570 aa  1160    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.653705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3304  acetolactate synthase catalytic subunit  43.99 
 
 
567 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2924  acetolactate synthase catalytic subunit  39.93 
 
 
576 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.304337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4075  acetolactate synthase catalytic subunit  31.59 
 
 
611 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15200  acetolactate synthase catalytic subunit  30.26 
 
 
586 aa  207  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0947  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.72 
 
 
543 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10808  thiamine pyrophosphate enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13620)  27.93 
 
 
562 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0432  acetolactate synthase catalytic subunit  29.04 
 
 
538 aa  177  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  25.47 
 
 
556 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1526  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.67 
 
 
652 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29328 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.87 
 
 
562 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.25 
 
 
562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  26.61 
 
 
552 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.19 
 
 
563 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  24.83 
 
 
578 aa  130  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.11 
 
 
563 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  24.91 
 
 
595 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.91 
 
 
595 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  25.22 
 
 
595 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0294  putative pyruvate decarboxylase  26.52 
 
 
590 aa  127  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  26.69 
 
 
552 aa  127  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.88 
 
 
596 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  26.63 
 
 
567 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  26.93 
 
 
541 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  27.45 
 
 
541 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  26.8 
 
 
554 aa  124  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.56 
 
 
600 aa  123  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  23.34 
 
 
566 aa  121  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  27.01 
 
 
541 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  24.13 
 
 
549 aa  120  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.96 
 
 
559 aa  120  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  26.98 
 
 
558 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.87 
 
 
574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.32 
 
 
574 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  25.41 
 
 
562 aa  118  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1817  thiamine pyrophosphate protein central region  25.31 
 
 
595 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.97 
 
 
540 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.41 
 
 
574 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  21.97 
 
 
565 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  24.96 
 
 
567 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  25.81 
 
 
551 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.79 
 
 
574 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  26.56 
 
 
553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  26.98 
 
 
545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.66 
 
 
566 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  23.8 
 
 
576 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0846  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.19 
 
 
574 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  24.02 
 
 
582 aa  114  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.2 
 
 
658 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.59 
 
 
562 aa  114  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  24.56 
 
 
548 aa  114  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0736  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.33 
 
 
597 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.591869  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.3 
 
 
563 aa  114  7.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.18 
 
 
561 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.32 
 
 
593 aa  113  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.21 
 
 
556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.09 
 
 
549 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.01 
 
 
564 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.48 
 
 
574 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.95 
 
 
572 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0179  hypothetical protein  28.39 
 
 
537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.29 
 
 
563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.45 
 
 
574 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145283  hitchhiker  0.0000405432 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  27.47 
 
 
561 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  24.22 
 
 
575 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  27.98 
 
 
543 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4680  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.45 
 
 
574 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107751 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  25 
 
 
623 aa  110  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.91 
 
 
562 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.87 
 
 
566 aa  110  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.26 
 
 
572 aa  110  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0754  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.56 
 
 
574 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.91 
 
 
562 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4678  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.28 
 
 
574 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000775214 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  22.44 
 
 
566 aa  109  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  26.33 
 
 
552 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  25.3 
 
 
552 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  25.09 
 
 
583 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  23.74 
 
 
550 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1959  acetolactate synthase, large subunit  27.73 
 
 
570 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.82 
 
 
567 aa  108  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30090  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  25.37 
 
 
553 aa  108  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.492934  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42520  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.43 
 
 
574 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  27.39 
 
 
533 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.96 
 
 
569 aa  108  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1006  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.79 
 
 
574 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.850126  hitchhiker  0.0000000000038167 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  24.42 
 
 
550 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  24.77 
 
 
550 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  24.42 
 
 
550 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.39 
 
 
564 aa  107  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.51 
 
 
579 aa  107  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  24.83 
 
 
567 aa  107  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25 
 
 
552 aa  107  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.96 
 
 
542 aa  107  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5039  acetolactate synthase large subunit  25.17 
 
 
611 aa  107  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.818274  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.17 
 
 
570 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.17 
 
 
570 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.99 
 
 
564 aa  107  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.17 
 
 
570 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  26.62 
 
 
549 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>