More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2208 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2208  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
266 aa  524  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1590  RNA methyltransferase  57.69 
 
 
276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00137189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2611  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.46 
 
 
275 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1579  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.09 
 
 
275 aa  288  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0875411  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3443  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.93 
 
 
269 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146237  normal  0.0184697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3752  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.6 
 
 
269 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0797241  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.89 
 
 
274 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.144012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3341  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.13 
 
 
274 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0749589 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3534  RNA methylase  52.96 
 
 
279 aa  269  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1178  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.03 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3553  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.27 
 
 
268 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3641  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.38 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0439997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5195  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.85 
 
 
269 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1533  RNA methyltransferase  54.02 
 
 
226 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5969  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.38 
 
 
272 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223084  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1015  RNA methyltransferase  45.91 
 
 
271 aa  229  4e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.16 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.666902  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33920  rRNA methylase  41.48 
 
 
267 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3008  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.61 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10898  rRNA methyltransferase  40.75 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3233  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.24 
 
 
307 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4850  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.11 
 
 
270 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.0422374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4467  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.11 
 
 
270 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4554  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.11 
 
 
270 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4718  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.92 
 
 
268 aa  158  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5036  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.92 
 
 
275 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2601  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.38 
 
 
267 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220558  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0570  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.42 
 
 
272 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0835  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.15 
 
 
266 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1877  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.11 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1254  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.83 
 
 
284 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0496  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.21 
 
 
283 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1715  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.92 
 
 
268 aa  148  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41968  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1263  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.41 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143361  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1160  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.35 
 
 
304 aa  145  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.542606  normal  0.44269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5673  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.82 
 
 
332 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2671  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  38.99 
 
 
275 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535925  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2264  putative rRNA methylase  39.48 
 
 
268 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0826  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.44 
 
 
269 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2126  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.84 
 
 
269 aa  141  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0768131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7648  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.37 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01360  rRNA methylase  35.97 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.591406  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05470  rRNA methylase  34.98 
 
 
286 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.35 
 
 
269 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21660  rRNA methylase  36.03 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1614  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.43 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.329704  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0846  tRNA/rRNA methyltransferase  38.98 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1436  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.09 
 
 
276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111419  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1180  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.49 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.452059  decreased coverage  0.000681553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2046  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.37 
 
 
279 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3360  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.77 
 
 
285 aa  125  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2254  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.34 
 
 
279 aa  125  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2308  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.5 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15820  rRNA methylase  34.4 
 
 
275 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.582235  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13580  rRNA methylase  36.64 
 
 
269 aa  123  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11630  rRNA methylase  37.36 
 
 
280 aa  122  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4007  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.82 
 
 
275 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.169703  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0599  rRNA methylase  33.22 
 
 
292 aa  122  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.441965  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.8 
 
 
283 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.869677 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0892  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.65 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04950  rRNA methylase  34.38 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0843  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.39 
 
 
280 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.105002 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.33 
 
 
290 aa  102  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.604815  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49451  predicted protein  30.67 
 
 
389 aa  97.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0221  RNA methyltransferase  38.24 
 
 
226 aa  94.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3539  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.91 
 
 
252 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0474859  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1418  conserved hypothetical protein, probable rRNA methyltransferase, TrmH family  38.78 
 
 
226 aa  86.7  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3055  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.56 
 
 
236 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.83 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.82 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.004624  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.51 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2993  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.35 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.246575  normal  0.0568105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3036  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.65 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0149  RNA methyltransferase  39.58 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.913365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00455486  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0310  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.51 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  33.87 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.33 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0808  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.38 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2517  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.54 
 
 
266 aa  79  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0189  RNA methyltransferase  37.5 
 
 
227 aa  79  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.8 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0168  RNA methyltransferase  37.5 
 
 
227 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  26.11 
 
 
238 aa  78.6  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.8 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1093  23S rRNA methyltransferase  24.62 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000062165  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0139  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.72 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1853  RNA methyltransferase  22.56 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683239  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2978  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.77 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1164  hypothetical protein  33.1 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  32.99 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3022  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.77 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1148  RNA methyltransferase  32.87 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1908  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.82 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0830  RNA methyltransferase  30.59 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0190975  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.57 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  25.86 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2650  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.38 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00276989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  31.06 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1374  RNA methyltransferase  27.78 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>