295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1836 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1836  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 116 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118319  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8317  Endoribonuclease L-PSP  75.86 
 
 		 117 aa  185  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.535132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1930  endoribonuclease L-PSP  54.46 
 
 		 123 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4363  endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 		 115 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1829  hypothetical protein  47.79 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000709548  normal  0.28873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4268  Endoribonuclease L-PSP  43.86 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  38.6 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  38.6 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  38.6 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  38.6 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  40.35 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  38.6 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4336  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.597458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4413  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333895  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  41.24 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7400  hypothetical protein  41.49 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  41.24 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  37.5 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  35.96 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2929  Endoribonuclease L-PSP  39.18 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  36.27 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  35.92 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5525  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 106 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  33.93 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  33.93 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  38.24 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  36.36 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  34.55 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  32.74 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  36.08 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  35.35 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  36.08 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0725  Endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.37819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1080  Endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  35.42 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2203  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000019478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06343  hypothetical protein  34 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4372  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  34.91 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1289  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5822  hypothetical protein  35.42 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2762  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  33.04 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1889  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121968  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0582  putative Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1019  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.669958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1345  endoribonuclease  36.21 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0475282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67140  hypothetical protein  39.02 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0475  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  35.96 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>