More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0582 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0582  putative Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 121 aa  237  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6378  Endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0807375  normal  0.458934 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 		 114 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0992  hypothetical protein  48.65 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0934  endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  47.86 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  50.43 
 
 		 115 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  47.83 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  47.83 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  52.73 
 
 		 115 aa  103  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  52.73 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  50.93 
 
 		 115 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0475  endoribonuclease L-PSP  47.41 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2929  Endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  45.3 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  45.3 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0725  Endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.37819 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  38.18 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  41.23 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  42.86 
 
 		 115 aa  97.1  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  43.59 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  40.35 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  40.35 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  40.35 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  40.35 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6255  Endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  40.35 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1345  endoribonuclease  41.07 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0475282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7400  hypothetical protein  39.66 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2936  hypothetical protein  41.74 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 113 aa  94.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2886  Endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  40.54 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1019  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 112 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.669958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  48.08 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  37.93 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  38.89 
 
 		 113 aa  91.7  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  41.59 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 119 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 119 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5822  hypothetical protein  43.48 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 117 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2626  Endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1989  Endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  37.93 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  37.93 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0349  endoribonuclease L-PSP family protein  40 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.682229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  41.18 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4336  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.597458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1889  Endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121968  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  38.46 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67140  hypothetical protein  42.61 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0372  endoribonuclease L-PSP family protein  40 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  38.14 
 
 		 118 aa  86.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  37.29 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>