More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0349 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0349  endoribonuclease L-PSP family protein  100 
 
 
116 aa  239  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.682229  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0372  endoribonuclease L-PSP family protein  99.14 
 
 
116 aa  237  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0700  endoribonuclease L-PSP  44.55 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219752  normal  0.0254422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0666  hypothetical protein  43.64 
 
 
120 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  43.24 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  38.94 
 
 
118 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 
118 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 
118 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0582  putative Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 
117 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 
118 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 
115 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2622  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 
116 aa  88.2  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2400  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 
113 aa  87.4  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0934  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 
139 aa  87  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989038  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 
117 aa  87  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0992  hypothetical protein  38.6 
 
 
114 aa  87  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6378  Endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0807375  normal  0.458934 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1345  endoribonuclease  37.84 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0475282  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  39.25 
 
 
114 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
116 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  35.09 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  35.09 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  35.09 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1019  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.669958  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  39.25 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  36.45 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  39.25 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  39 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 
114 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  36.45 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  39.42 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  34 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  34 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  38.39 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  35.58 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  36.94 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 
124 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3717  Endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 
117 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.306574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2929  Endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 
115 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6255  Endoribonuclease L-PSP  39.36 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  35.96 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2026  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.232751  normal  0.248157 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  37 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  34.23 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2762  endoribonuclease L-PSP  37.11 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  34.82 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0475  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7057  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945657  normal  0.394054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  37.04 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  35.09 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  35.09 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1889  Endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121968  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7400  hypothetical protein  35.71 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0725  Endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 
116 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.37819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  33.33 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  33.04 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1289  Endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>