More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1289 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1289  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 120 aa  245  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  50.96 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0475  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  49.51 
 
 		 117 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  48.11 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  46.53 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  45.79 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  45.63 
 
 		 117 aa  104  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  46.6 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1345  endoribonuclease  42.34 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0475282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  42.86 
 
 		 115 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  48.04 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1019  endoribonuclease L-PSP  42.34 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.669958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  43.69 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  45.37 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  45.37 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  44.34 
 
 		 115 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  45.71 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  42.73 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2622  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 116 aa  98.6  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  42.72 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  39.29 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  43.27 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5466  endoribonuclease L-PSP  48.04 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  39.29 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  46.67 
 
 		 118 aa  97.4  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 		 117 aa  97.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  46.6 
 
 		 118 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  45.19 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  46.6 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  46.15 
 
 		 133 aa  96.7  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000040  endoribonuclease L-PSP family protein  40.52 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1080  Endoribonuclease L-PSP  44.76 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  43.69 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  43.27 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2936  hypothetical protein  43.14 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  43.27 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  41.75 
 
 		 117 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  43.12 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  43.12 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  43.12 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  44.23 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  43.12 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4426  endoribonuclease L-PSP  45.37 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0537399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  43.27 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  44.23 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  41.75 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3717  Endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306574 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0992  hypothetical protein  45.63 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0934  endoribonuclease L-PSP  45.63 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  42.2 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  42.2 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  42.2 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7400  hypothetical protein  40.78 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  38.89 
 
 		 116 aa  90.1  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4372  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 117 aa  88.6  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  42.16 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2626  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 116 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  40.38 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  44.55 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6378  Endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0807375  normal  0.458934 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  42.86 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  45.63 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0691  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4397  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.455291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2018  endoribonuclease L-PSP  41.58 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.711263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2407  hypothetical protein  41.58 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000841178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2400  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690402  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2129  endoribonuclease L-PSP  41.58 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>