222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0666 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0666  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0700  endoribonuclease L-PSP  95.58 
 
 		 115 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219752  normal  0.0254422 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0349  endoribonuclease L-PSP family protein  43.64 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.682229  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0372  endoribonuclease L-PSP family protein  43.64 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2400  endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  41.74 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  41.74 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  41.74 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  41.74 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  42.61 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0934  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989038  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0992  hypothetical protein  44 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6378  Endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0807375  normal  0.458934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  37.72 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  39.64 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4336  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.597458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4413  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333895  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0582  putative Endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  37.84 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  36.94 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  39.81 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2622  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2929  Endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5466  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7057  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945657  normal  0.394054 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1080  Endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  38.46 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1889  Endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121968  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  33.04 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8317  Endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.535132  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0725  Endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.37819 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6255  Endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  33.33 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  34.51 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  33.33 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2227  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39224  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2203  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000019478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1836  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118319  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7400  hypothetical protein  31.48 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06343  hypothetical protein  28.7 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1989  Endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3717  Endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5822  hypothetical protein  35.14 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>