More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1930 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1930  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 123 aa  254  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4363  endoribonuclease L-PSP  60.18 
 
 		 115 aa  146  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1836  endoribonuclease L-PSP  54.46 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118319  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8317  Endoribonuclease L-PSP  55.36 
 
 		 117 aa  126  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.535132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1829  hypothetical protein  43.24 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000709548  normal  0.28873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  42.72 
 
 		 118 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4268  Endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2026  endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.232751  normal  0.248157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  38.3 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  37.65 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7400  hypothetical protein  38.3 
 
 		 116 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  31.86 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  34.62 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2936  hypothetical protein  36.27 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4413  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333895  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  30.09 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1289  Endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  30.09 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  30.09 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  30.09 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  32.46 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  34.12 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  34.34 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2626  Endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2886  Endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  34.69 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  30.36 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  33.04 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  33.04 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  32.14 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  36 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  32.98 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2203  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000019478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  34.31 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0725  Endoribonuclease L-PSP  35.37 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.37819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  32.74 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  32.14 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5822  hypothetical protein  34.95 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  31.73 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  29.46 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  31.82 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4336  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.597458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5525  endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1654  endoribonuclease L-PSP  36.05 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00696625  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  28.32 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  28.32 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4372  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  30.95 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  34.04 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2814  endoribonuclease L-PSP  34.34 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0582  putative Endoribonuclease L-PSP  31.31 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000040  endoribonuclease L-PSP family protein  33.04 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67140  hypothetical protein  33.98 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0575  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  30.77 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0691  Endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>