More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4268 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4268  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 119 aa  237  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8317  Endoribonuclease L-PSP  43.86 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.535132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1836  endoribonuclease L-PSP  43.86 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118319  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2929  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  39.47 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4363  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  38.94 
 
 		 116 aa  84.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1829  hypothetical protein  38.61 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000709548  normal  0.28873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1930  endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  36.79 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6378  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0807375  normal  0.458934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  36.28 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0725  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.37819 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  36.28 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  36.28 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  36.28 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  36.28 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  34.86 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  33.91 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2936  hypothetical protein  35.96 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  38.78 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  35.58 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  35.59 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01779  hypothetical protein  34.31 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.893197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2036  endoribonuclease L-PSP family protein  34.31 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.818249  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2536  endoribonuclease L-PSP family protein  34.31 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0868618  normal  0.902173 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1834  Endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00508894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1897  endoribonuclease L-PSP family protein  34.31 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01767  hypothetical protein  34.31 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.712473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2069  endoribonuclease L-PSP family protein  34.31 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1379  endoribonuclease L-PSP family protein  34.31 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618035  normal  0.177039 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1824  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.387771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  33.98 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  33.02 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1123  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5525  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  32.08 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  32.38 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  32.38 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7400  hypothetical protein  34.62 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2626  Endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2762  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4397  endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.455291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4426  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0537399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2407  hypothetical protein  31.58 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000841178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2018  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.711263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2129  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1979  Endoribonuclease L-PSP  39 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  33.04 
 
 		 114 aa  67  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  33.04 
 
 		 114 aa  67  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2379  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 114 aa  67  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  36.54 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000040  endoribonuclease L-PSP family protein  33.02 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  36.52 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>