More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1382 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  100 
 
 
307 aa  606  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  74.75 
 
 
307 aa  461  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  73.74 
 
 
310 aa  447  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  74.75 
 
 
305 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  74.75 
 
 
305 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  68.75 
 
 
308 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  68.35 
 
 
307 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  69.74 
 
 
308 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  69.08 
 
 
308 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  62.71 
 
 
308 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  59.67 
 
 
308 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  59.34 
 
 
308 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  59.74 
 
 
308 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  58.45 
 
 
307 aa  351  8e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  58.47 
 
 
300 aa  348  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  57.98 
 
 
312 aa  346  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  57.84 
 
 
312 aa  346  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  56.08 
 
 
307 aa  342  5e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  59.15 
 
 
309 aa  341  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  57.28 
 
 
296 aa  338  8e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  57.7 
 
 
308 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  59.15 
 
 
307 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  58.82 
 
 
307 aa  331  9e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  55.85 
 
 
310 aa  329  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  56.54 
 
 
291 aa  326  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  57.84 
 
 
291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  58.17 
 
 
306 aa  323  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  56.11 
 
 
301 aa  320  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  56.61 
 
 
301 aa  318  5e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  55.37 
 
 
308 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  57.19 
 
 
306 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  57.19 
 
 
306 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  53.29 
 
 
307 aa  316  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  57.09 
 
 
307 aa  316  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.5 
 
 
303 aa  315  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  56.48 
 
 
310 aa  309  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  55.96 
 
 
291 aa  301  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  53.69 
 
 
308 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  49.68 
 
 
303 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  51.68 
 
 
308 aa  277  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  53.72 
 
 
298 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  53.72 
 
 
298 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  53.4 
 
 
298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  48.22 
 
 
292 aa  257  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  48.7 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  46.23 
 
 
294 aa  252  7e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  47.91 
 
 
310 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  48.22 
 
 
293 aa  250  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  44.16 
 
 
311 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  48.21 
 
 
293 aa  249  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  48.21 
 
 
293 aa  249  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  44.95 
 
 
289 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  48.22 
 
 
292 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  45.02 
 
 
294 aa  245  9e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  45.48 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  45.66 
 
 
299 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  46.38 
 
 
294 aa  235  8e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  45.78 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0516  elongation factor Ts  41.38 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.203151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  43.41 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  42.53 
 
 
292 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  45.87 
 
 
303 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  45.18 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  45.87 
 
 
303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  45.31 
 
 
291 aa  231  9e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  42.21 
 
 
292 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  44 
 
 
287 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  43.87 
 
 
292 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  43.87 
 
 
292 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  46.28 
 
 
292 aa  227  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  45.48 
 
 
294 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0515  elongation factor Ts  40.83 
 
 
288 aa  225  9e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  42.72 
 
 
312 aa  225  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  43 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  44.16 
 
 
295 aa  222  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  43.83 
 
 
295 aa  222  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  44.16 
 
 
295 aa  221  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  44.16 
 
 
295 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  40.89 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  44.48 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  43.83 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  43.83 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  43.83 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  43.83 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  43.83 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  43.83 
 
 
295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  45.1 
 
 
296 aa  219  5e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  45.1 
 
 
296 aa  219  5e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  45.55 
 
 
267 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  47.44 
 
 
286 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.92 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  45.19 
 
 
290 aa  216  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  44.12 
 
 
292 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  44.81 
 
 
292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  41.58 
 
 
286 aa  215  7e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  42.86 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  43.51 
 
 
285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  41.24 
 
 
288 aa  211  9e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  44.12 
 
 
294 aa  210  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  44.44 
 
 
294 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>