51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0651 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  100 
 
 		 428 aa  840    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  42.48 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  42.68 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  41.49 
 
 		 433 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  32.16 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  30.94 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  29.38 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  32.34 
 
 		 425 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  26.11 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  29.97 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  31.16 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  29.79 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  25.71 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  24.65 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  30.11 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  27.15 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  24.41 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  27.64 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  29.17 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  29.08 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  27.22 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  24.46 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  29.7 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  29.75 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  31.01 
 
 		 313 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  26.64 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  27.5 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  22.94 
 
 		 595 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  27.65 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  22.94 
 
 		 595 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  22.94 
 
 		 595 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  22.94 
 
 		 595 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  22.94 
 
 		 595 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  22.94 
 
 		 595 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  22.94 
 
 		 661 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  28.86 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  31.53 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  22.94 
 
 		 595 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  24.43 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  34.65 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 443 aa  46.6  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  25.18 
 
 		 607 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  31.85 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  22.67 
 
 		 592 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  22.67 
 
 		 592 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  22.67 
 
 		 592 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 593 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0988  putative lipoprotein  26.85 
 
 		 466 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  25 
 
 		 578 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>