216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0293 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
369 aa  731    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  65.56 
 
 
373 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  66.57 
 
 
373 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  65.22 
 
 
371 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  62.53 
 
 
371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  63.66 
 
 
357 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  60.45 
 
 
412 aa  441  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  63.08 
 
 
413 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  57.59 
 
 
366 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  58.92 
 
 
367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  59.54 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  57.76 
 
 
377 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  57.76 
 
 
375 aa  401  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  57.47 
 
 
375 aa  398  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  53.39 
 
 
367 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  53.8 
 
 
370 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  51.35 
 
 
380 aa  345  8e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  51.35 
 
 
380 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  50.54 
 
 
366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 
377 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  51.15 
 
 
378 aa  332  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  50.58 
 
 
371 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  50.13 
 
 
378 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  50.55 
 
 
363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  50.55 
 
 
363 aa  329  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 
383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  49.31 
 
 
378 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  48.46 
 
 
374 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  48.86 
 
 
373 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  51.87 
 
 
376 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  49.42 
 
 
373 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  49.3 
 
 
371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  48.29 
 
 
373 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  47.58 
 
 
367 aa  312  5.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  48.41 
 
 
401 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  48.11 
 
 
367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  46.69 
 
 
374 aa  309  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  48.2 
 
 
371 aa  309  5.9999999999999995e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  49.18 
 
 
365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 
368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  48.44 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  46.24 
 
 
376 aa  301  9e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  45.53 
 
 
363 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  46.74 
 
 
384 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  46.69 
 
 
386 aa  299  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 
386 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  45.58 
 
 
369 aa  296  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  46.78 
 
 
367 aa  292  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  47.85 
 
 
367 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  47.25 
 
 
365 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  47.17 
 
 
368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  46.44 
 
 
371 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  43.73 
 
 
365 aa  286  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  45.68 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  43.21 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  44.26 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  45.04 
 
 
370 aa  282  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  44.92 
 
 
370 aa  279  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  43.7 
 
 
364 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  45.07 
 
 
392 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  44.54 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  43.65 
 
 
363 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  42.12 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  44.29 
 
 
369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  44.25 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  43.6 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  43.36 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  46.74 
 
 
378 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  43.24 
 
 
380 aa  273  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  43.4 
 
 
369 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  43.4 
 
 
369 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  42.82 
 
 
368 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  45.06 
 
 
398 aa  270  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  43.84 
 
 
369 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  43.84 
 
 
369 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  44.54 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  44.25 
 
 
363 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  44.25 
 
 
363 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  44.25 
 
 
363 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  44.25 
 
 
363 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  41.62 
 
 
369 aa  268  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  44.48 
 
 
398 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  44.25 
 
 
363 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  43.39 
 
 
363 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  43.13 
 
 
371 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  42.23 
 
 
366 aa  266  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  43.05 
 
 
367 aa  265  7e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  42.98 
 
 
392 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  41.94 
 
 
367 aa  265  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  43.14 
 
 
362 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  46.4 
 
 
370 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  43.27 
 
 
394 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  43.13 
 
 
363 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  43.1 
 
 
361 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  42.42 
 
 
377 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  45.74 
 
 
365 aa  261  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  44.99 
 
 
374 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  42.53 
 
 
386 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  44.14 
 
 
376 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  42.02 
 
 
369 aa  258  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>