69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2721 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  100 
 
 
425 aa  837    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  34.28 
 
 
356 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  31.25 
 
 
384 aa  146  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  31.25 
 
 
382 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  29.76 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  30.38 
 
 
387 aa  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  31.75 
 
 
383 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  30.41 
 
 
387 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  27.54 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  30.97 
 
 
386 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  31.42 
 
 
368 aa  119  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0548586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  30.97 
 
 
386 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  28.14 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  26.91 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  24.05 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  28.53 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  26.82 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  26.09 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  25.14 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  22.71 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  25.48 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  24 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  24.2 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  28.16 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  27.44 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  25.24 
 
 
452 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  27.44 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  24.3 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  24.3 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  26.18 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  23.84 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  29.92 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  24.29 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0825  hypothetical protein  27.6 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  28.52 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  26.04 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  25.96 
 
 
424 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  24.05 
 
 
407 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  22.9 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  28.12 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  24.82 
 
 
445 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  24.29 
 
 
446 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  23.93 
 
 
475 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0805  periplasmic lipoprotein-like protein  26.45 
 
 
355 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  26.35 
 
 
384 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  21.75 
 
 
420 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  25.91 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  28.99 
 
 
410 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  24.4 
 
 
338 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  27.88 
 
 
354 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  23.38 
 
 
448 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  27.22 
 
 
354 aa  57.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  24 
 
 
426 aa  57  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  27.05 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  21.24 
 
 
372 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  25.75 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  25.37 
 
 
354 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  30.17 
 
 
379 aa  53.5  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  25.38 
 
 
399 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  22.67 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  27.9 
 
 
422 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  25.37 
 
 
354 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  25 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  26.18 
 
 
329 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  24.46 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  26.54 
 
 
486 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  26.61 
 
 
329 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  25.36 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  22.47 
 
 
429 aa  43.1  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>